A protocol for systematic review on global diversity of human immunodeficiency virus-1 subtypes
Notice bibliographique
Résumé
Background: Human Immunodeficiency Virus (HIV)-1 subtypes are heterogeneously distributed around the world. Recent works on near full-length genome sequencing of HIV-1 shows increasing events of different recombinant variants and subtype C viruses. The active change in HIV-1 subtype distribution patterns initiate global challenges for diagnosis, treatment and antiretroviral (ARV) drug design. Objectives: Present study has been initiated to provide a summary of the current data on the HIV-1 subtype diversity and distribution by region. Methods: The data will be extracted through data extraction form as per Population, Intervention, Comparison, Outcomes and Study (PICOS) framework. Risk of bias and quality assessment will be performed with the help of Egger’s test and modified Newcastle - Ottawa Quality Assessment Scale respectively. The protocol registration number was International Prospective Register for Systematic Reviews (PROSPERO) number CRD42023400199. Results: The pattern of HIV-1 subtypes and Circulating Recombinant Form (CRF)/Unique Recombinant Form (URF) along with their geographical distribution around the world. Conclusion: The future systematic review, which will be generated from the present protocol, may provide evidence of the diversity of HIV-1 subtypes around the world. The present protocol might be handy to conduct a systemic review (and meta-analysis, if possible) on the global diversity of HIV-1 subtypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,087 | 0,165 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,005 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,018 | 0,012 |
| Bibliométrie | 0,016 | 0,017 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,006 |
| Communication savante | 0,008 | 0,008 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,007 | 0,008 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,090 | 0,009 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».