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Enregistrement W4409612896 · doi:10.3126/jkmc.v12i3.64356

A protocol for systematic review on global diversity of human immunodeficiency virus-1 subtypes

2023· article· en· W4409612896 sur OpenAlexaboutno aff
Mihir Bhatta, A. S. Majumdar, Snehasudha S Sahoo, Shanta Dutta

Notice bibliographique

RevueJournal of Kathmandu Medical College · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHuman immunodeficiency virus (HIV)Protocol (science)VirologyDiversity (politics)Computational biologyPathologyBiologyAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Human Immunodeficiency Virus (HIV)-1 subtypes are heterogeneously distributed around the world. Recent works on near full-length genome sequencing of HIV-1 shows increasing events of different recombinant variants and subtype C viruses. The active change in HIV-1 subtype distribution patterns initiate global challenges for diagnosis, treatment and antiretroviral (ARV) drug design. Objectives: Present study has been initiated to provide a summary of the current data on the HIV-1 subtype diversity and distribution by region. Methods: The data will be extracted through data extraction form as per Population, Intervention, Comparison, Outcomes and Study (PICOS) framework. Risk of bias and quality assessment will be performed with the help of Egger’s test and modified Newcastle - Ottawa Quality Assessment Scale respectively. The protocol registration number was International Prospective Register for Systematic Reviews (PROSPERO) number CRD42023400199. Results: The pattern of HIV-1 subtypes and Circulating Recombinant Form (CRF)/Unique Recombinant Form (URF) along with their geographical distribution around the world. Conclusion: The future systematic review, which will be generated from the present protocol, may provide evidence of the diversity of HIV-1 subtypes around the world. The present protocol might be handy to conduct a systemic review (and meta-analysis, if possible) on the global diversity of HIV-1 subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,087
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,165
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,458

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0870,165
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0180,012
Bibliométrie0,0160,017
Études des sciences et des technologies0,0050,006
Communication savante0,0080,008
Science ouverte0,0050,004
Intégrité de la recherche0,0070,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0900,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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