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Enregistrement W4409631479 · doi:10.1158/1538-7445.am2025-5431

Abstract 5431: The mitochondrial protease, YME1L regulates interferon signaling and is essential for AML growth and differentiation

2025· article· en· W4409631479 sur OpenAlexaff
Yihe Zhang, Rose Hurren, Yongran Yan, Marcela Gronda, Dakai Ling, Karen Fang, Andrea Arruda, Mark D. Minden, Aaron D. Schimmer

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInterferonBiologyCell biologyProteaseCancer researchImmunologyEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Yeast Mitochondrial Escape 1-Like 1 (YME1L) is an ATP-dependent metalloprotease located in the inner mitochondrial membrane. Here, we examined the expression and function of this protease in AML. YME1L protein was expressed in 6/7 tested AML cell lines. In 17 of 23 primary AML samples, YME1L protein was > 2-fold higher than normal hematopoietic cells. High YME1L mRNA expression was associated with lower five-year survival rates in AML patients.To assess the dependency of AML cells on this protease, we knocked down YME1L with shRNA in OCI-AML2, NB4, TEX, and THP-1 AML cell lines. YME1L knockdown reduced AML cell proliferation in these tested lines. In addition, the depletion of YME1L reduced the clonogenic growth of leukemia cells, and decreased the engraftment of AML cells into the marrow of immune-deficient NS-GF mice. Thus, YME1L is essential for AML cells and leukemia-initiating cells. To understand the mechanisms of action of this protease and the downstream consequences of its depletion, we measured changes in gene expression after the knockdown of YME1L in OCI-AML2 cells. By RNA sequencing, knockdown of YME1L upregulated genes associated with defense response to viruses, response to type I interferon, and type I interferon signaling pathways, consistent with viral mimicry and induction of interferon (IFN) signaling. Using real-time PCR we confirmed the importance of YME1L in regulating these pathways. Knockdown of YME1L upregulated the expression of beta and gamma IFN, as well as downstream interferon-stimulated genes ISG15, IFI44, and IFIT2. Upregulation of IFN pathways and induction of viral mimicry, can promote the differentiation of AML cells. Therefore, we assessed the differentiation of leukemic cells after the knockdown of YME1L. Knockdown of YME1L induced the differentiation of OCI-AML2 cells as evidenced by upregulation of CD14 protein expression.In summary, YME1L is overexpressed in a subset of AML cells. This protease is essential for AML cells and controls differentiation by regulating IFN and viral mimicry pathways. Citation Format: Yihe Zhang, Rose Hurren, Yongran Yan, Marcela Gronda, Dakai Ling, Karen Kai-Lin Fang, Andrea Arruda, Mark D. Minden, Aaron D. Schimmer. The mitochondrial protease, YME1L regulates interferon signaling and is essential for AML growth and differentiation [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 5431.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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