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Enregistrement W4409635946 · doi:10.1158/1538-7445.am2025-6337

Abstract 6337: A novel PMS2 mutant Lynch syndrome mouse model for cancer prevention studies

2025· article· en· W4409635946 sur OpenAlexaboutno aff
Kajal Biswas, Yurong Song, Vaishnavi Peddibhotla, Brandon Somerville, Mary Albaugh, Dillon Dierman, Altaf Mohammed, Shyam K. Sharan, Robert H. Shoemaker

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLynch syndromePMS2CancerMutantCancer preventionMedicineInternal medicineGeneticsCancer researchBiologyColorectal cancerGeneDNA mismatch repair

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mono-allelic germline pathogenic variants (GPVs) in MMR genes (MLH1, MSH2, PMS2, and MSH6) predispose individuals to hereditary non-polyposis colorectal cancer (HNPCC), better known now as Lynch syndrome (LS). Bi-allelic GPVs in MMR genes lead to a severe phenotype, constitutional MMR deficiency (CMMRD), that is characterized by early onset of leukemia/lymphoma, colorectal/gastrointestinal tumors, brain tumors, and sarcomas. MMR deficient mouse models have provided many mechanistic and translational insights. Pms2-null (Pms2ko/ko) mice were found to be viable but showed an increase in microsatellite instability and developed lymphomas and sarcomas. One of the most frequently occurring human mutations in PMS2 is a founder mutation NM_000535.5:c.2002A>G (p.I668V), observed in the Canadian Inuit population (1 in 16 Inuits are carriers). This mutation acts as a de novo splice site that creates a 5 bp deletion resulting in a truncated protein (p.I668*). A mouse model with an equivalent germline mutation (Pms2c.1993A>G) results in a splicing defect like that observed in humans and exhibits a significant increase in microsatellite instability and intestinal adenomas on an Apc mutant (Apctm1Rak ) background. We are now further characterizing this model for intestinal tumor initiation and progression using time course experiments and comparing tumor development by histopathological examination with the Pms2ko/ko model. Moreover, we are also examining this model to identify neoantigens, that may lead to development of a new vaccine for PMS2 mutation carriers.This mouse model can be a valuable tool to test the efficacy of new strategies for cancer prevention in PMS2 mutation carriers. We have developed a luciferase based splicing reporter assay in HEK293 cells that can be used to screen splicing modulators to suppress aberrant splicing of this splice site mutation. The efficacy of these modulators to suppress aberrant splicing in the small intestine of mice can be further tested using this mouse model. Citation Format: Kajal Biswas, Yurong Song, Vaishnavi Peddibhotla, Brandon Somerville, Mary Albaugh, Dillon Dierman, Rameesha Mustafa, Altaf Mohammed, Shyam K. Sharan, Robert H. Shoemaker. A novel PMS2 mutant Lynch syndrome mouse model for cancer prevention studies [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2025; Part 1 (Regular Abstracts); 2025 Apr 25-30; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2025;85(8_Suppl_1):Abstract nr 6337.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,065

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,245
Tête enseignante GPT0,511
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
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