Dual-Gene Based Recombinase-Aided Amplification (RAA) - Lateral Flow Strip for the Sensitive On-Site Detection of <i>Yersinia enterocolitica</i> in Food Samples
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Yersinia enterocolitica is one of the most common foodborne pathogens worldwide. Currently, most detection methods are primarily focused on pathogenic strains of Y. enterocolitica; while it has been frequently observed that traditionally believed "non-pathogenic" strains of Y. enterocolitica can also cause human disease. OBJECTIVE: Herein, we have developed a novel dual-recombinase-aided amplification (RAA)-lateral flow test strip assay targeting both of a pathogenic marker (ail) and a conserved gene (foxA) for the rapid detection of both pathogenic and non-pathogen Y. enterocolitica strains in food samples. METHODS: Primers and probes were designed and optimized for the detection of ail and foxA genes using RAA technology. The optimal RAA-LFS assay was then evaluated for specificity and sensitivity, and validated in both chicken samples spiked with a series of ten-fold diluted Y. enterocolitica cultures and 100 natural food samples including milk, chicken, beef, pork, and salmon. RESULTS: The newly designed assay demonstrated 100% specificity and achieved a detection limit of 17 CFU/reaction for both targets, with the entire sample preparation and detection process completed within 25 min. Additionally, the assay showed high sensitivity in spiked chicken samples, achieving a detection limit of 1.03 × 10-1 CFU/mL for both targets. Validation with the natural food samples confirmed the robustness of the assay, as the results from this new assay were in agreement with those from the commonly used traditional techniques. CONCLUSIONS: In summary, the dual RAA-LFS assay integrates two genetic markers into a single test strip, providing a rapid, cost-effective, specific, and sensitive tool for on-site detection of pathogenic and common Y. enterocolitica strains. HIGHLIGHTS: A novel dual RAA-LFS assay for the rapid detection of both pathogenic and common Y. enterocolitica strains was developed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».