A novel approach for feline sporotrichosis pathogen detection based on loop‐mediated isothermal amplification
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Sporotrichosis is a chronic, mycotic infection caused by fungi of the genus Sporothrix. Zoonotic sporotrichosis occurs mainly through S. brasiliensis transmission, resulting from the organism's traumatic introduction via scratches or bites, or contact with exudate from contaminated cats. The loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay is a viable molecular alternative for detecting Sporothrix in veterinary low-resource settings. HYPOTHESIS/OBJECTIVES: To develop a LAMP method for Sporothrix identification using fungal isolates and clinical samples of domestic cats (Felis catus). MATERIALS AND METHODS: DNA samples were collected from Sporothrix isolates and clinical samples of cats positive for sporotrichosis. Six LAMP primers were designed to amplify the 28S ribosomal RNA region of S. schenckii and S. brasiliensis. Colorimetric assay and agarose gel electrophoresis were used to analyse the LAMP amplification. Isolated samples were sequenced using the Sanger technique, employing the amplification of genetic material by conventional PCR with the external primers of LAMP. RESULTS: A sensitivity of 96.77% for isolated Sporothrix samples was found using the LAMP method, confirmed by Sanger sequencing. The detection limit of LAMP was between 1 and 10 pg of Sporothrix DNA according to the sample matrix. LAMP showed a sensitivity of 100% using blood samples, 77.78% using intranasal swabs and 92.31% and 100% using swab and adhesive tape samples of cutaneous lesions, respectively. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: These findings support a simple and quick LAMP-based screening tool for detecting Sporothrix in isolated and clinical samples. This accessible test can aid in disease management when standard culture analysis is unavailable or impractical.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».