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Enregistrement W4409699503 · doi:10.22215/cujs.v3i2.4825

Caspase Activation in an In-Vitro Model of Parkinson’s Disease

2025· article· en· W4409699503 sur OpenAlexaff
Aurora Tracy, Kate Harris, Matthew R. Holahan

Notice bibliographique

RevueCarleton undergraduate journal of science. · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParkinson's diseaseIn vitroNeuroscienceApoptosisCaspase 3CaspaseDiseaseMedicineChemistryBiologyInternal medicineBiochemistryProgrammed cell death

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parkinson’s disease (PD) is the second most prevalent neurodegenerative disorder worldwide with a key hallmark of its pathology being the degeneration of dopaminergic neurons in the substantia nigra (SNc) due to intraneuronal accumulation of Lewy bodies. Lewy bodies form through the aggregation of the monomer alpha-synuclein protein (aSyn), which can misfold into toxic fibrils that disrupt cellular homeostasis and cause apoptosis. While there is no cure for PD, establishing good in-vitro models is essential to further research of the disease and to developing possible treatments and therapies. This study’s goal was to develop an in-vitro model of PD using SH-SY5Y cells that would allow us to test the properties of our DNA-aptamer, a-syn-1, in preventing aSyn aggregation and development of pathology. This model was created by differentiating the SH-SY5Y cells into N-type neuroblast-like cells using retinoic acid following either Protocol A (full media with 10% FBS) or Protocol B (reduced media with 1% FBS) before adding aSyn filbrils. The cells were then stained with a Caspase-3/7 Green reagent and a NucBlue counterstain and were imaged at 24 h, 48 h, 72 h, and 96 h time points. We found that Protocol A showed no significant caspase activation at any of the timepoints and became overgrown with S-type epithelial-like cells after 94 h. Protocol B showed less cell proliferation and less S-type cells at the 94 h time point. Future studies will perform caspase testing on Protocol B to determine if it is the ideal in-vitro PD model before adding a-syn-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,309
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,003
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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