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Enregistrement W4409717279 · doi:10.1016/j.jbc.2025.108531

The mechanism of peptidoglycan O-acetylation in Gram-negative bacteria typifies bacterial MBOAT-SGNH acyltransferases

2025· article· en· W4409717279 sur OpenAlexafffund
Alexander C. Anderson, Bailey J. Schultz, Eric Snow, Ashley S. Brott, Stefen Stangherlin, Tyler Malloch, J London, Suzanne Walker, Anthony J. Clarke

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesGovernment of SaskatchewanNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Glycomics NetworkNational Science FoundationCanadian Institutes of Health ResearchNetworks of Centres of Excellence of CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Research Council CanadaCanada Foundation for InnovationFoundation for the National Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversity of SaskatchewanHarvard Medical SchoolNational Institutes of Health
Mots-clésPeptidoglycanAcyltransferasesMechanism (biology)GramAcetylationGram-negative bacteriaBacteriaMicrobiologyChemistryGram-positive bacteriaBiochemistryBiologyEscherichia coliGeneticsEnzymeBiosynthesisPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial cell envelope polymers are commonly modified with acyl groups that provide fitness advantages. Many polymer acylation pathways involve pairs of membrane-bound O-acyltransferase (MBOAT) and SGNH family proteins. As an example, the MBOAT protein PatA and the SGNH protein PatB are required in Gram-negative bacteria for peptidoglycan O-acetylation. The mechanism for how MBOAT-SGNH transferases move acyl groups from acyl-CoA donors made in the cytoplasm to extracellular polymers is unclear. Using the peptidoglycan O-acetyltransferase proteins PatAB, we explore the mechanism of MBOAT-SGNH pairs. We find that the MBOAT protein PatA catalyzes auto-acetylation of an invariant Tyr residue in its conserved C-terminal hexapeptide motif. We also show that PatB can use a synthetic hexapeptide containing an acetylated tyrosine to donate an acetyl group to a peptidoglycan mimetic. Finally, we report the structure of PatB, finding that it has structural features that shape its activity as an O-acetyltransferase and distinguish it from other SGNH esterases and hydrolases. Taken together, our results support a model for peptidoglycan acylation in which a tyrosine-containing peptide at the MBOAT's C-terminus shuttles an acyl group from the MBOAT active site to the SGNH active site, where it is transferred to peptidoglycan. This model likely applies to other systems containing MBOAT-SGNH pairs, such as those that O-acetylate alginate, cellulose, and secondary cell wall polysaccharides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,447

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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