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Enregistrement W4409726846 · doi:10.1101/2025.04.21.649531

Tissue scarring provides a biomechanical framework to promote mammalian bile duct regeneration through the activation of integrin-SRC/FAK signalling.

2025· preprint· en· W4409726846 sur OpenAlexfundno aff
Alexander Walker, Paula Olaizola, Eoin Brennan, Edward J. Jarman, Yuelin Yao, Elizabeth Carmichael, Andreea Grãdinaru, Alexander E.P. Loftus, David H. Wilson, Anabel Martinez Lyons, Laura Charlton, Kimberley Ober-Vliegen, Wunan Mi, Amy Broeders, Kyle Davies, Neil O. Carragher, Asier Unciti‐Broceta, Timothy J. Kendall, Luc J. W. van der Laan, Monique M.A. Verstegen, Margaret C. Frame, Scott H. Waddell, Luke Boulter

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePediatric Hepatobiliary Diseases and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilEuropean CommissionCarnegie Trust for the Universities of ScotlandCancer Research UKWellcome TrustInstitute of GeneticsFibroGen
Mots-clésProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcIntegrinCell biologyRegeneration (biology)SignallingBile ductChemistrySignal transductionBiologyMedicineReceptorInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Following chronic injury, the adult mammalian bile duct regenerates by forming new branches, essentially replumbing the ductular system to overcome blockages and breaks. To regenerate effectively, biliary epithelial cells (BECs) receive a range of pro-mitogenic signals from myofibroblasts, which concurrently deposit a collagen-rich scar around the duct as it regrows. Despite epithelial regeneration and scarring occurring side-by-side, whether the deposition of scar tissue regulates ductular regeneration per se remains unclear. By inducing ductular fibrosis and regeneration in vivo, we show that the formation of collagen-I-rich scars around regenerating ducts changes the local biomechanical properties of these tissues, promoting the growth of ducts. Critically, this changing structural landscape is perceived by a spatially restricted population of biliary epithelial cells which forms a leading-tip of integrin-alpha2-high cells. This leading-tip undergoes partial-EMT-type reprogramming, allowing it to become migratory and coordinate ductular regeneration. We show that this process is directly driven through an integrin-alpha2-SRC/FAK signalling axis; thereby connecting epithelial regeneration directly to the changing fibrotic environment in chronic ductular disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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