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Enregistrement W4409737509 · doi:10.1101/gr.280161.124

Extreme heterochiasmy and high rates of sex-reversed recombination result in large yet homomorphic sex chromosomes in the Emei moustache toad

2025· article· en· W4409737509 sur OpenAlexafffund
Jun Li, W. C. Chen, Chunhua Huang, Yan Feng, Qingbo Ai, Mian Zhao, Judith E. Mank, Hua Wu

Notice bibliographique

RevueGenome Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyGeneticsPseudoautosomal regionRecombinationX chromosomeChromosomeChiasmaSex reversalMeiosisY chromosomeSex linkagePopulationKaryotypeEvolutionary biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unlike the highly degenerated sex chromosomes in birds and mammals, many amphibians possess homomorphic sex chromosomes, which may result from high rates of sex chromosome turnover and/or occasional recombination between the X and Y (or Z and W) Chromosomes. Yet, the molecular basis for maintaining homomorphy remains elusive, particularly the power of rare recombination events to arrest sex chromosome divergence. Here, we identified sex chromosomes of the Emei moustache toad and examined potential mechanisms of maintaining homomorphy. Although the sex chromosomes are homomorphic, we observed an extensive region of X-Y genetic differentiation, spanning ∼349 Mb, among the largest known to date in vertebrates. Despite this large size and the assumption that inversions catalyze recombination suppression between the X and Y Chromosomes, we found little evidence of XY structural variation. Using a high-density linkage map, we revealed that the large region of X-Y divergence was likely owing to the emergence of sex determining factors in the region of ancestrally low male recombination. Population genetic data showed high rates of sex-reversed XY-type females, and recombination between the X and Y Chromosomes in these individuals helps maintain the integrity of sequence and gene expression on the Y Chromosome. Finally, we revealed modest sexualization of gene expression within the sex chromosomes, and identified candidate genes involved in gonadal development. Our results not only show remarkable maintenance of vast sex differentiated regions under ancestral low recombination but also emphasize the sustaining power of X-Y recombination for homomorphic chromosomes over large genomic regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,578
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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