Genome-wide identification of Morus notabilis Aquaporin gene family and differential expression of plasma membrane intrinsic proteins in response to Ralstonia pseudosolanacearum infection
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Aquaporins (AQPs) play crucial roles in plant water transport, growth and development, and response to biotic and abiotic stresses. Despite their essential functions, the role of AQPs in mulberry trees (Morus L.) during Ralstonia pseudosolanacearum infection remains largely unknown. RESULTS: In this study, we performed a genome-wide identification and comprehensive characterization of AQP genes in Morus notabilis. A total of 26 AQP genes were identified and classified into four subfamilies: NIP, PIP, SIP and TIP. Furthermore, detailed analyses were conducted on gene structures, protein physicochemical properties, transmembrane domains, phylogenetic relationships, and subcellular localization. Cis-acting element analysis showed that MnAQP genes were mainly involved in hormone, light and stress response. Tissue-specific expression analysis demonstrated that the PIP1 subfamily displayed significantly higher transcript abundance in root tissues relative to leaves, while the PIP2 subfamily maintained relatively stable expression patterns across various tissue types. In addition, following R. pseudosolanacearum inoculation, the expression levels of PIP genes were significantly upregulated in the roots, stems, and leaves of mulberry seedlings. These findings indicate that MnPIP genes play a crucial role in responding to R. pseudosolanacearum infection. CONCLUSIONS: This study provides the comprehensive characterization of the AQP gene family in mulberry, clarifying the composition and diversity. Our findings establish a solid foundation for further understanding the function roles of MnPIPs following R. pseudosolanacearum infection in mulberry trees. CLINICAL TRIAL NUMBER: Not applicable.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».