<i>Cryptococcus neoformans</i> Biofilm Formation and Quantification
Notice bibliographique
Résumé
Cryptococcus neoformans is an opportunistic fungal pathogen that heads the Fungal Priority Pathogen List published by the World Health Organization (WHO) in 2022. This pathogen is a primary cause of death for immunocompromised individuals (e.g., those with HIV/AIDS, the elderly, immunotherapy recipients), causing approximately 118,000 deaths yearly worldwide. C. neoformans relies on virulence factors that include a polysaccharide capsule, melanin, extracellular enzymes, and thermotolerance to initiate and sustain host infection. Additionally, similar to other fungal pathogens (e.g., Candida albicans), C. neoformans may develop a biofilm organization linked to more persistent cryptococcal infections. Cryptococcal biofilms are highlighted in cases of cryptococcal meningitis, in which biofilm-like structures form that are highly resistant to host immune response and to antifungal therapies. In this regard, fungal biofilm formation has become an important area of study as a means to improve our understanding of the mechanisms regulating biofilm formation and infection and to advance the discovery of antibiofilm therapeutics. To assess biofilm properties and compare across treatments, quantification and evaluation of cell viability are important. Herein, we describe a standardized method to establish a cryptococcal biofilm and quantify total biomass and cell viability. © 2025 The Author(s). Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: Culturing and biofilm formation Basic Protocol 2: Biofilm quantification Alternate Protocol: Biofilm viability assay.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,023 | 0,020 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».