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Enregistrement W4409829861 · doi:10.1093/icesjms/fsaf017

Pathways for converting zooplankton traits to ecological insights are paved with findable, accessible, interoperable, and reusable (FAIR) data practices

2025· article· en· W4409829861 sur OpenAlexafffund
Jessica Titocci, Patrick R. Pata, Tiziana Durazzano, Sakina‐Dorothée Ayata, Corentin Clerc, Astrid Cornils, Patrick I. Duffy, Adam T. Greer, Claudia Halsband, Ryan Heneghan, Anaïs Lacoursière‐Roussel, Fabien Lombard, Sanna Majaneva, Evgeny A. Pakhomov, Carolina Reis, Sinja Rist, Alix C M Rommel, Teresa Silva, Lars Stemmann, Kevin Ugwu, Alberto Basset, Ilaria Rosati, Kieran Murphy, Brian P. V. Hunt

Notice bibliographique

RevueICES Journal of Marine Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Space AgencyNorth Pacific Marine Science OrganizationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHorizon 2020Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorMarine Environmental Observation Prediction and Response Network
Mots-clésInteroperabilityZooplanktonEcologyComputer scienceBiologyWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The use of trait-based approaches and trait data in zooplankton ecology is rapidly growing to better understand and predict the patterns of zooplankton distributions and their role in aquatic ecosystems and biogeochemical cycles. Although the number of zooplankton trait-based studies and available trait datasets is increasing, several challenges remain for the findability, accessibility, interoperability, and reusability (FAIR) in trait-based approaches that, if unaddressed, may stifle progress in this research area. Here, we review recent applications of trait-based approaches in zooplankton research and summarize the currently available trait data resources. To realize the potential of trait-based approaches to resolve ecological roles of zooplankton, datasets and approaches must adhere to FAIR principles. We provide recommendations and pathways forward to ensure FAIRness while highlighting the importance of collaborative efforts. These practical and easily implementable strategies will enhance the FAIRness of trait data, ultimately advancing zooplankton ecological research and connecting these findings to aquatic ecosystem functioning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,200
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,295
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2000,295
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0120,010
Études des sciences et des technologies0,0030,010
Communication savante0,0230,041
Science ouverte0,0060,023
Intégrité de la recherche0,0040,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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