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Enregistrement W4409838115 · doi:10.1038/s44298-025-00115-y

High host specificity of alphacoronaviruses in Nearctic, insectivorous bats

2025· article· en· W4409838115 sur OpenAlexafffundabout
Jonathon D. Kotwa, Arkadeb Bhuinya, Winfield Yim, Giulia Gallo, Pahul Singh, Qiang Liu, Anil Kumar, Emily Chien, Aaron Hou, Hsien-Yao Chee, Juliette Blais-Savoie, Lily Yip, Valerie von Zuben, Karel Wouters, Vikram Misra, Oliver Lung, Dalan Bailey, Finlay Maguire, Arinjay Banerjee, Samira Mubareka, Christina M. Davy

Notice bibliographique

Revuenpj Viruses · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of TorontoDalhousie UniversityUniversity of ManitobaCarleton UniversityCanadian Food Inspection AgencyTrent UniversityMinistry of Natural Resources and ForestryUniversity of SaskatchewanSunnybrook Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitute of Infection and ImmunityInnovation SaskatchewanCanadian Institutes of Health ResearchAssociation of Medical Microbiology and Infectious Disease CanadaGovernment of Ontario
Mots-clésInsectivoreNearctic ecozoneHost (biology)BiologyZoologyEcologyTaxonomy (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bats are reservoir hosts for a number of coronaviruses, some of which may pose spillover risks for humans and other animals. We detected two alphacoronaviruses in big brown bats ( Eptesicus fuscus ) and little brown myotis ( Myotis lucifugus ) in Ontario, Canada. These viruses are closely related to other coronaviruses circulating in bats in North America and also distantly related to human and swine coronaviruses. We found high similarity in the receptor-binding domain (RBD) in viruses derived from the same species of bat, but markedly lower in those derived from other species. We also functionally characterized the accessory protein ORF3 finding that ORF3 inhibited both IFNβ production and signaling. Our study provides insights into coronavirus diversity in bats in a previously under-sampled region. This work provides a baseline for in-depth surveillance to characterize the transmission dynamics of endemic coronaviruses in free-ranging wildlife, and for exploring the evolutionary relationships between coronaviruses and their hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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