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Enregistrement W4409852860 · doi:10.1101/2025.04.24.650479

An Enantioselective Chemical Probe for Chikungunya nsP2 Helicase with Antialphaviral Activity

2025· preprint· en· W4409852860 sur OpenAlexafffund
M. Bose, Hans J. Oh, John D. Sears, Chun‐Hsing Chen, Anand Vala, Shubin Liu, Kacey M. Talbot, Mohammad Anwar Hossain, Peter J. Brown, Scott Houliston, Julia Garcia Perez, Fengling Li, Meareg Amare, Peter Halfmann, Jessica R. Smith, Alec J. Hirsch, C.H. Arrowsmith, Levon Halabelian, Ava M. Vargason, Rafael M. Couñago, Jamie J. Arnold, Craig E. Cameron, Nathaniel J. Moorman, Mark T. Heise, Timothy M. Willson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryGenentechUNC Eshelman School of Pharmacy, University of North Carolina at Chapel HillOntario Genomics InstituteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMerck KGaANational Institutes of HealthOntario GenomicsGenome CanadaMcGill UniversityNorth Carolina Biotechnology CenterBayerBristol-Myers SquibbPfizerNational Science Foundation
Mots-clésChikungunyaEnantioselective synthesisHelicaseVirologyComputer scienceChemistryPhysicsBiologyVirusBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Chikungunya virus (CHIKV) replication relies on the multifunctional nsP2 protein, making it an attractive target for antiviral drug discovery. Here, we report the resolution of oxaspiropiperidine 1 , a first-in-class inhibitor of the CHIKV nsP2 RNA helicase (nsP2hel), into its constitutive enantiomers and characterization of their antiviral activity. The enantiomer ( R )- 1 exhibited potent inhibition of viral replication, nsP2hel ATPase activity, and dsRNA unwinding, while the ( S )- 1 enantiomer was >100-fold less active. The ( R )- 1 enantiomer also demonstrated high selectivity for CHIKV over other RNA viruses and for nsP2hel over other RNA helicases. Direct binding of ( R )- 1 to nsP2hel protein was confirmed by 19 F NMR. Biophysical and structural studies revealed conformational polymorphism in the spirocyclic scaffold of ( R )- 1 , suggesting a potential role of thermal mobility of the ligand in allosteric inhibition of nsP2hel. Collectively, these findings designate ( R )- 1 (RA-NSP2-1) as a high-quality chemical probe and ( S )- 1 (RA-NSP2-1N) as a negative control for probing the biology of alphavirus RNA helicases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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