Unraveling HIV Reservoir Persistence and Dynamics in Peripheral Blood and the Central Nervous System during Antiretroviral Therapy
Notice bibliographique
Résumé
Since the introduction of effective antiretroviral therapy (ART) in 1996, HIV has shifted from a fatal disease to a chronic infection. While ART suppresses viral replication, it does not remove the latent HIV reservoir from the cells, necessitating lifelong treatment. Most research focuses on the viral reservoir in the cells of the peripheral blood, but HIV also persists in cells of other tissues, including in the brain. This PhD thesis examines the dynamics of the HIV reservoir in both blood and brain tissue. We optimized a quantification technique capable of quantifying both HIV subtype B, prevalent in high-income countries, and subtype C, the most predominant subtype globally. Using this technique, we followed individuals on ART for 20 years and found that while the reservoir declines early in treatment, it stabilizes after a decade. In the brain, we identified the microglia cells as the primary HIV reservoir. This was studied using a newly developed microglia culture system and postmortem brain tissue from individuals with HIV. We demonstrated that viruses isolated from these could establish productive infection in these culture systems. Due to challenges in isolating intact cells from frozen brain tissue, we instead analyzed cell nuclei and found increased immune activation in individuals with HIV, even in those on ART. This persistent immune activation may contribute to cognitive impairments, known as HIV-associated neurocognitive disorder (HAND). These findings improve our understanding of the HIV reservoir in both blood and brain, as well as the potential harmful effects of HIV. Crucially, they highlight the need for innovative cure strategies and improvements in existing treatments to better address HAND.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».