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Enregistrement W4409889295 · doi:10.1021/acs.jmedchem.5c00220

Broad Target Screening Reveals Abundance of FKBP12-Based Molecular Glues in Focused Libraries

2025· article· en· W4409889295 sur OpenAlexafffund
Johannes K. Dreizler, Christian Meyners, Wisely Oki Sugiarto, Maximilian Repity, Edvaldo Vasconcelos Soares Maciel, Patrick L. Purder, Frederik Lermyte, Stefan Knapp, Felix Hausch

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensStructural Genomics Consortium
Organismes subventionnairesStructural Genomics ConsortiumBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésFKBPDrug discoveryChemistryComputational biologyDrug repositioningDrugBiochemistryPharmacologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Competitive (nondegradative) molecular glues represent a promising drug modality that remains underexplored primarily due to the lack of adequate hit identification approaches. In this study, we screened our historically grown FKBP-focused library containing >1000 drug-like molecules to identify FKBP-assisted molecular glues targeting a diverse panel of 57 proteins. In addition to establishing a robust and generalizable screening approach, we discovered three novel FKBP-dependent molecular glues targeting PTPRN, BRD4 BD2, and STAT4. Our results demonstrate that molecular glues are more common than previously thought and that they can be identified by repurposing existing focused libraries. An optimized, highly cooperative FKBP12-BRD4 BD2 glue demonstrated the involvement of the BD2 pocket and exhibited selectivity over the closely related BD1 domain. Our results underscore the value of FKBP12-assisted molecular glues to target challenging proteins with the potential for high selectivity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,668

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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