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Enregistrement W4410014280 · doi:10.1016/j.microb.2025.100368

Integrative research: Current trends and considerations for biomarker discovery and precision medicine

2025· article· en· W4410014280 sur OpenAlexaff
Jessica Cockburn, Vanitha Mariappan, Mun Fai Loke, Anis Rageh Al‐Maleki, Muttiah Barathan, Kumutha Malar Vellasamy, Jamuna Vadivelu

Notice bibliographique

RevueThe Microbe · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrecision medicineBiomarker discoveryData scienceCurrent (fluid)BiomarkerMedicineMedical physicsComputer scienceBiologyEngineeringPathologyProteomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The development of molecular biology, from the discovery of DNA's double-helix to current genomic tools, has revolutionized biomedical science. Integrative research, with the inclusion of genomic, proteomic, and clinical data, plays a critical role in biomarker identification and precision medicine. This review describes how integrative approaches enable better disease classification, such as breast cancer, for targeted therapy and improved patient care. Some of the most important technology advancements—next-generation sequencing, multi-omics integration, artificial intelligence, and single-cell omics—have sped up this field. With the use of directed and undirected biomarker discovery platforms, researchers can identify specific molecular markers or explore novel candidates in different biological layers. These methods have enabled the exploration of complex diseases, from COVID-19 to chronic conditions. Nevertheless, data complexity, computational limitations, and ethical concerns in personalized diagnosis persist. To overcome them, is the key to crossing the gap from computational knowledge into medical application. Enhancing the diagnostics of diseases, improving therapeutics' precision, and facilitating patient therapy are the general objectives of integrated investigations. By advancing the most technology available in computing and molecules, researchers are going towards more precision-guided and effective medicine. • Molecular biology and multi-omics enable targeted therapies and precise disease classification. • Key tools: next-generation sequencing, single-cell omics, AI-driven analytics. • Challenges: data integration, computational demands, clinical translation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,059
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,036
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0590,036
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0030,025
Communication savante0,0150,029
Science ouverte0,0050,008
Intégrité de la recherche0,0120,018
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
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Résumé présentoui

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