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Enregistrement W4410131331 · doi:10.1021/acschembio.5c00158

Selective Small-Molecule Activator of Patient-Derived GPX4 Variant

2025· article· en· W4410131331 sur OpenAlexaff
Hengrui Liu, F. Forouhar, Russell P. Saneto, Brent R. Stockwell

Notice bibliographique

RevueACS Chemical Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthColumbia University
Mots-clésActivator (genetics)ChemistrySmall moleculeComputational biologyBiologyGeneticsCell biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glutathione peroxidase 4 (GPX4) is distinguished from other members of the GPX family as being the enzyme capable of reducing phospholipid hydroperoxides within cellular membranes and therefore protecting cells from ferroptosis, a form of iron-driven cell death involving lipid peroxidation. We previously identified a homozygous point mutation in the GPX4 gene, resulting in an R152H coding mutation and a substantial loss of GPX4 enzymatic activity, in patients with Sedaghatian-type spondylometaphyseal dysplasia (SSMD), an ultrarare progressive disorder. To explore whether selective binding and correction of the loss of enzyme activity observed with this variant is possible, we screened 2.8 billion compounds in a DNA-encoded chemical library and identified compounds with remarkably selective binding affinities with the R152H variant (GPX4 R152H ) over wild-type (GPX4 WT ). Our structural optimization of these compounds led to the identification of analogues with improved potency for R152H GPX4. The most promising compounds selectively restored the enzyme activity of GPX4 R152H and specifically increased the viability of fibroblast and lymphoblast cells developed from an SSMD patient with the homozygous R152H variation but not control cells from a healthy parent or HEK293T cells undergoing ferroptosis induced by a wild-type GPX4 inhibitor. This approach represents a low-cost, high-throughput, and generalizable approach to identify targeted small-molecule therapeutics for missense variants, which features the potential to be broadly applied to diseases that bear point mutations on crucial proteins, including cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,542

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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