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Enregistrement W4410203609 · doi:10.1101/2025.05.02.651925

High-Throughput Evaluation of Cryoprotective Agents for Mixture Effects That Reduce Toxicity

2025· preprint· en· W4410203609 sur OpenAlexaff
Nima Ahmadkhani, Cameron Sugden, James D. Benson, Ali Eroğlu, Adam Z. Higgins

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésToxicityDimethyl sulfoxideDiethylene glycolGlycerolVitrificationChemistryCryopreservationPropanediolToxicologyEthylene glycolBiologyOrganic chemistryMedicineEmbryoAndrology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vitrification is a promising approach for cryopreserving complex biological structures such as organs. However, to prevent ice formation, high concentrations of cell-permeable cryoprotective agents (CPAs) are required, which can be highly toxic. The current reliance on a small number of CPAs limits optimization of low-toxicity compositions for vitrification. To address this, there is growing interest in uncovering novel chemicals with analogous protective qualities. This may not only enhance vitrification efficacy but also mitigate toxic effects. In the current study, we employed a high throughput method to assess the toxicity of 21 compounds at room temperature, both individually and in binary combinations. Our analysis revealed that toxicity increases with both exposure duration and concentration, and that several CPA combinations result in reduced overall toxicity. Notably, among all tested mixtures, four binary combinations-formamide/glycerol, dimethyl sulfoxide/1,3-propanediol, 1,2-propanediol/diethylene glycol, and 1,3-propanediol/diethylene glycol-produced a statistically significant decrease in toxicity, resulting in significantly higher viability for the 6 mol/kg mixture than both corresponding 6 mol/kg single CPA solutions. The high-throughput approach presented here will aid in building a comprehensive CPA toxicity database, which will improve our understanding of toxicity mechanisms and support the development of predictive models for identifying novel CPA mixtures with low toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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