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Enregistrement W4410218486 · doi:10.1016/j.xgen.2025.100876

Identification of targetable vulnerabilities of PLK1-overexpressing cancers by synthetic dosage lethality

2025· article· en· W4410218486 sur OpenAlexafffund
Chelsea E. Cunningham, Frederick S. Vizeacoumar, Yue Zhang, Liliia Kyrylenko, Simon Both, Vincent Maranda, He Dong, Jared D. W. Price, Peng Gao, Konrad Wagner, Yingwen Wu, Mary Lazell-Wright, Ashtalakshmi Ganapathysamy, Rithik Hari, Kalpana K. Bhanumathy, Connor Denomy, Anjali Saxena, Jeff Patrick Vizeacoumar, Alain Morejon Morales, Faizaan Khan, Shayla R. Mosley, A. Chen, Tetiana Katrii, Ben G. E. Zoller, Karthic Rajamanickam, Prachi Walke, Lihui Gong, Hardikkumar Patel, Hussain Elhasasna, Renuka Dahiya, Omar Abuhussein, Anton E. Dmitriev, Tanya Freywald, Érika Prando Munhoz, Eytan Ruppin, Joo Sang Lee, Katharina Rox, Martin Köebel, Laura Hopkins, Cheng‐Han Lee, Sunil Yadav, Gilles Gasparoni, Jörn Walter, Anand Krishnan, Raju Datla, Behzad M. Toosi, Kristi Baker, Jalna Meens, David W. Cescon, Laurie Ailles, Scot C. Leary, Yuliang Wu, Martin Empting, Alexandra K. Kiemer, Andrew Freywald, Franco J. Vizeacoumar

Notice bibliographique

RevueCell Genomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkCameco (Canada)University of CalgaryGlobal Institute for Water SecurityAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of SaskatchewanUniversity of AlbertaSaskatchewan Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanada Foundation for InnovationCanadian Institutes of Health ResearchMitacsSaskatchewan Health Research FoundationCancer Research SocietySaskatchewan Cancer AgencyDeutsche ForschungsgemeinschaftUniversity of Saskatchewan
Mots-clésSynthetic lethalityLethalityIdentification (biology)Cancer researchMedicineComputational biologyBiologyToxicologyGeneticsDNA repairDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromosomal instability (CIN) drives tumor heterogeneity, complicating cancer therapy. Although Polo-like kinase 1 (PLK1) overexpression induces CIN, direct inhibition of PLK1 has shown limited clinical benefits. We therefore performed a genome-wide synthetic dosage lethality (SDL) screen to identify effective alternative targets and validated over 100 candidates using in vivo and in vitro secondary CRISPR screens. We employed direct-capture Perturb-seq to assess the transcriptional consequences and viability of each SDL perturbation at a single-cell resolution. This revealed IGF2BP2 as a critical genetic dependency that, when targeted, downregulated PLK1 and significantly restricted tumor growth. Mechanistic analyses showed that IGF2BP2 loss disrupted cellular energy metabolism and mitochondrial ATP production by downregulating PLK1 levels as well as genes associated with oxidative phosphorylation. Consistent with this, pharmacological inhibition of IGF2BP2 severely impacts the viability of PLK1-overexpressing cancer cells addicted to higher metabolic rates. Our work offers a novel therapeutic strategy against PLK1-driven heterogeneous malignancies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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