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Enregistrement W4410222177 · doi:10.1101/2025.05.07.25327065

<i>APOE</i> stratified genome-wide association studies provide novel insights into the genetic etiology of Alzheimers’s disease

2025· preprint· en· W4410222177 sur OpenAlexaff
Jesper Qvist Thomassen, Hampton L. Leonard, Brittany Ulms, Benjamin Grenier‐Boley, Sami Heikkinen, Pablo García‐González, Masataka Kikuchi, Jungsoo Gim, Han Cao, Fahri Küçükali, Najaf Amin, Dabin Yoon, Itziar de Rojas, Pilar Álvarez Jerez, Victoria Álvarez, Beatrice Arosio, Céline Bellenguez, Sverre Bergh, Kimberly J Billingsley, Cornelis Blauwendraat, Merçé Boada, Barbara Borroni, Paola Bossù, María J. Bullido, Antonio Daniele, Ángel Carracedo, Alexandre de Mendonça, Mark Cookson, Jürgen Deckert, Martin Dichgans, Srdjan Djurovic, Oriol Dols‐Icardo, Carole Dufouil, Emrah Düzel, Valentina Escott‐Price, Tormod Fladby, Laura Fratiglioni, Amy K.Y. Fu, Daniela Galimberti, José María García‐Alberca, Vilmantas Giedraitis, Guillermo García‐Ribas, Caroline Graff, Timo Grimmer, Edna Grünblatt, Olivier Hanon, Lucrezia Hausner, Stefanie Heilmann‐Heimbach, Jakub Hort, Frank Jessen, Kendall Van Keuren‐Jensen, Caroline Jonson, Y. Kim, Nicole Kuznetsov, Ville Leinonen, Anssi Lipponen, Jiao Luo, Mary B. Makarious, Henna Martiskainen, Carlo Masullo, Patrizia Mecocci, Shima Mehrabian, Pablo Mir, Akinori Miyashita, Susanne Moebus, Kin Y. Mok, Laura Molina‐Porcel, Fermín Moreno, Benedetta Nacmias, Lucilla Parnetti, Pau Pástor, Jordi Pérez‐Tur, Oliver Peters, Yolande A.L. Pijnenburg, Gerard Piñol‐Ripoll, Julius Popp, Innocenzo Rainero, Luís Miguel Real, Steffi G. Riedel‐Heller, Eloy Rodríguez‐Rodríguez, Arvid Rongve, Giacomina Rossi, José Luís Royo, Dan Rujescu, Ingvild Saltvedt, María Eugenia Sáez, Raquel Sánchez‐Valle, Florentino Sánchez-García, Nicolai Sandau, Nikolaos Scarmeas, Katja Scheffler, Norbert Scherbaum, Anja Schneider, Geir Selbæk, Davide Seripa, Vincenzo Solfrizzi, Marco Spallazzi, Alessio Squassina, Eystein Stordal, Niccoló Tesi, Lucio Tremolizzo, Kumar Parijat Tripathi, Wiesje M. van der Flier, Julie Williams, Jens Wiltfang, Dag Aarsland, Andrew Singleton, Philippe Amouyel, Stéphanie Debette, Gaël Nicolas, Sven J. van der Lee, Henne Holstege, María Victoria Fernández, Patrick G. Kehoe, Kristel Sleegers, Martin Ingelsson, Roberta Ghidoni, Ole A. Andreassen, Peter Holmans, Pascual Sánchez‐Juan, Rebecca Sims, Nancy Y. Ip, Kun Ho Lee, Takeshi Ikeuchi, Alfredo Ramı́rez, Agustı́n Ruiz, Mikko Hiltunen, Jean‐Charles Lambert, Cornelia M. van Duijn, Mike A. Nalls, Ruth Frikke‐Schmidt

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensOntario Brain InstituteUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care ResearchUniversité de LilleNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SLundbeckfondenDevelopment of Innovative Strategies for a Transdisciplinary approach to ALZheimer's diseaseZonMwInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleUniversity of OxfordHjerteforeningen
Mots-clésEtiologyAlzheimer's diseaseApolipoprotein EDiseaseGenome-wide association studyGenetic associationAssociation (psychology)BiologyMedicineGeneticsEvolutionary biologyComputational biologyPathologyGenotypePsychologyGeneSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Among the more than 90 identified genetic risk loci for late-onset Alzheimer’s disease (AD) and related dementias, the apolipoprotein E gene ( APOE ) ɛ2/ɛ3/ɛ4 polymorphisms remains the longstanding benchmark for genetic disease risk with a consistently large effect across studies 1–10 . Despite this massive signal, the exact mechanisms for how ɛ4 increases and for how ɛ2 decreases dementia risk is not well-understood. Importantly, recent trials of anti-amyloid therapies suggest less efficacy and higher risks of severe side effects in ε4 carriers 11–13 , hampering the treatment of those with the highest unmet need. To improve our understanding of the genetic architecture of AD in the context of its main genetic driver, we performed genome-wide association studies (GWASs) stratified by ε4 and ε2 carrier status. Such insights may help to understand and overcome side effects, to impact clinical trial enrolment strategies, and to create the scientific basis for targeted mechanism-driven therapies in neurodegenerative diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,065

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0190,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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