Association Between Exposome, Deoxyribonucleic Acid (DNA) Damage and Asthma in Colombian Children Aged 2 to 4 Years
Notice bibliographique
Résumé
Abstract RATIONALE: Asthma is a disease that affects millions of people worldwide and is the most prevalent childhood illness. Its pathophysiology is still not fully understood, and environmental exposures along with gene-environment interactions have been identified as major contributing factors to various diseases. This study aimed to determine the contribution of early-life exposome and DNA damage to asthma, as well as the modifying effect of genetic polymorphisms. METHODS: This is an analysis from the PROMESA cohort conducted in two of the most populous Colombian cities, involving children aged 2 to 4 years. The asthma diagnosis was made by pediatric pulmonologists following a standardized protocol. Genotyping was performed to evaluate the modifying effect of genetic polymorphisms (GSTT1, GSTM1, CYP1A1, H2AX, OGG1, and SOD2) using PCR and PCR-RFLP. The early-life exposome was estimated through geographic information systems, remote sensing, LUR models, and questionnaires. The association between the exposome and asthma was estimated using Elastic Net Poisson regression with a log link and adjusted by ancestry and covariates. Interactions were identified with ExWAS. RESULTS: In 2022, 506 children (median age: 3.7 years) were studied. Asthma prevalence in 407 children was 37% (95% CI: 32.6–41.9). DNA damage was consistent regardless of asthma or acute respiratory infections presence but was higher in children with asthma in Medellín than in Bogotá (Figure 1). Exposures to dogs at home, weekly cereal intake, NO₂ during the first year, street connectivity, and recent home renovations reduced asthma prevalence by 6-29%. Conversely, curtains/carpets at home and building density within 300 m increased asthma risk by 6-54% (PR: 1.54 [1.24-1.90]). ExWAS identified 41 gene-exposome interactions (p < 0.05), with three remaining significant: home reconstructions with P53 (null vs. present), proximity to roads with GSTT1 (null vs. present), and carpets with GSTT1 (null vs. present) (see last column Table 1)CONCLUSIONS: The interaction between exposome and genetic polymorphisms is complex in children with asthma. DNA damage was greater in children in Medellín, where disease prevalence was also higher, highlighting the role of environmental factors in pediatric asthma pathophysiology. Results indicate that not only indoor exposure can influence Asthma, but also exposure at neighborhood and city level, such as urban environment and air pollution. Genetic variants in DNA repair and antioxidant defense may modulate this exposure-asthma relation. These findings can guide health professionals in assessing pediatric patients and providing environmental, dietary, and housing recommendations to prevent chronic diseases like asthma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».