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Enregistrement W4410338584 · doi:10.1186/s40170-025-00391-5

Identification and impact of microbiota-derived metabolites in ascites of ovarian and gastrointestinal cancer

2025· article· en· W4410338584 sur OpenAlexaff
Sisi Deng, Qianlu Yang, Yogesh Singh, Gyuntae Bae, Nicolas Bézière, Lukas F. Mager, Stefan Kommoss, Jannik Sprengel, Christoph Trautwein

Notice bibliographique

RevueCancer & Metabolism · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesUniversitätsklinikum Tübingen
Mots-clésAscitesIdentification (biology)Ovarian cancerCancerMedicineInternal medicineBiologyGastroenterologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Malignant ascites is a common complication of advanced ovarian cancer (OC) and gastrointestinal cancer (GI), significantly impacting metastasis, quality of life, and survival. Increased intestinal permeability can lead to blood or lymphatic infiltration and microbial translocation from the gastrointestinal or uterine tract. This study aimed to identify microbiota-derived metabolites in ascites from OC (stages II-III and IV) and GI patients, assessing their roles in tumor progression. METHODS: Malignant ascites samples from 18 OC and GI patients were analyzed using a four-dimensional (4D) untargeted metabolomics approach combining reversed-phase (RP) and hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) with trapped ion mobility spectrometry time-of-flight mass spectrometry (timsTOF-MS). Additonally, a targeted flow cytometry-based cytokine panel was used to screen for inflammatory markers. Non-endogenous, microbiota-derived metabolites were identified through the Human Microbial Metabolome Database (MiMeDB). RESULTS: OC stage IV exhibited metabolic profiles similar to GI cancers, while OC stage II-III differed significantly. Stage IV OC patients exhibited higher levels of 11 typically microbiome-derived metabolites, including 1-methylhistidine, 3-hydroxyanthranilic acid, 4-pyridoxic acid, biliverdin, butyryl-L-carnitine, hydroxypropionic acid, indole, lysophosphatidylinositol 18:1 (LPI 18:1), mevalonic acid, N-acetyl-L-phenylalanine, and nudifloramide, and lower levels of 5 metabolites, including benzyl alcohol, naringenin, o-cresol, octadecanedioic acid, and phenol, compared to stage II-III. Correlation analysis revealed positive associations between IL-10 and metabolites such as glucosamine and LPCs, while MCP-1 positively correlated with benzyl alcohol and phenol. CONCLUSION: 4D metabolomics revealed distinct metabolic signatures in OC and GI ascites, highlighting microbiota-derived metabolites involved in lipid metabolism and inflammation. Metabolites like 3-hydroxyanthranilic acid, indole, and naringenin may serve as markers of disease progression and underscore the microbiota's role in shaping malignant ascites and tumor biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,485
Score d'incertitude au seuil0,554

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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