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Enregistrement W4410381979 · doi:10.1186/s12870-025-06666-9

Comparative metabolomics of two nettle species unveils distinct high-altitude adaptation mechanisms on the Tibetan Plateau

2025· article· en· W4410381979 sur OpenAlexafffund
Lijuan Deng, Yin-Lei Li, Fengying Wang, Richard I. Milne, Jie Liu, Zeng‐Yuan Wu

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedicinal plant effects and applications
Établissements canadiensThe Scarborough Hospital
Organismes subventionnairesNational Ten Thousand Talent ProgramRecruitment Program of Global ExpertsChina Scholarship CouncilUniversity of TorontoNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyMetabolic pathwayBotanyMetabolomicsPhenylpropanoidMetabolismBiochemistryBiosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The extreme high-altitude conditions of the Tibetan Plateau, characterized by intense solar radiation, low temperatures, and reduced oxygen levels, poses significant challenges to plant survival. Plants inhabiting this region have evolved specialized mechanisms to adapt to high-altitude environments. While most studies have focused on genomic and ecological perspectives, few have explored adaptive mechanisms in a metabolic context. In particular, comparative studies examining similarities and differences in the metabolomes of closely related species are exceedingly rare. As sister species, the nettle species Urtica hyperborea and U. dioica are distributed above 4000 m above sea level, with a sympatric distribution on the Tibetan Plateau, they provide an ideal system to investigate the aforementioned question. RESULTS: In this study, we conducted non-targeted metabolic profiling of the leaves from U. hyperborea and U. dioica collected at three sympatric sites on the Tibetan Plateau. A total of 2906 annotated metabolites were detected. Differential metabolites at Sites 1 (4697 m) and 3 (4465 m) were enriched in pathways for flavonoid, flavone and flavonol, and phenylpropanoid biosynthesis. In contrast, Site 2, located at the highest altitude (5007 m), primarily exhibited enrichment in carbon metabolism pathways. Regarding the altitudinal variation of the same species, common metabolic pathways between the two groups included fructose and mannose metabolism, α-linolenic acid metabolism, and glycerophospholipid metabolism. The metabolic pathways enriched only inU. hyperboreaincluded starch and sucrose metabolism, galactose metabolism, and phenylpropanoid biosynthesis. The metabolically enriched pathways specific toU. dioicaincluded pantothenate and coenzyme A biosynthesis, as well as glutathione metabolism. CONCLUSIONS: We found that the metabolic differences between the two sympatric species are primarily in carbohydrate and phenylpropanoid contents. The differential metabolites of the same species across different altitudes were enriched mainly in carbon metabolism pathways and lipid metabolism pathways. Thus, our study revealed that the high-altitude adaptation mechanisms of sympatric species are not identical. Moreover, adaptation strategies within the same species were generally consistent across altitudes, exhibiting only slight variations. This study provide novel insights into the adaptive metabolic strategies of U. hyperborea and U. dioica, contributing to a deeper understanding of the mechanisms underlying plant adaptation to extreme high-altitude conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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