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Enregistrement W4410420444 · doi:10.1101/2025.05.16.25327749

Automatic detection of n-degree family members

2025· preprint· en· W4410420444 sur OpenAlexaff
Emil M. Pedersen, Jette Steinbach, Carsten Bøcker Pedersen, Andrew J. Schork, Morten Dybdahl Krebs, Bjarni J. Vilhjálmsson, Florian Privé

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueFace and Expression Recognition
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesNovo Nordisk
Mots-clésDegree (music)Computer scienceMathematicsPhysicsAcoustics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Summary Research in the familial aggregation of diseases and traits utilise information on probands, and their relevant health information enriched with similar information for their family members of interest. The genealogy is typically generated from trio information in registers and biobanks. However it can be tedious and error prone to identify family members other than first-degree relatives. Here, we present a graph-based approach to effectively identify family members of arbitrary degree of relatedness, as well as the means to attach any desired information to each individual for downstream analysis and a function to efficiently calculate a kinship matrix for the identified family members and convert identified family members from a graph back into trio information. Availability and Implementation The R package where these new functionalities are implemented is available on GitHub ( https://github.com/EmilMiP/LTFHPlus ) and on CRAN ( https://cran.r-project.org/web/packages/LTFHPlus/index.html ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,927
Score d'incertitude au seuil0,623

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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