Canary in the Coal Mine: Two-Year Wastewater Surveillance Results from an Indicator Community for Early Indication of IAV, RSV, Mpox, and SARS-CoV-2 in Five Surrounding Towns and Cities
Notice bibliographique
Résumé
An indicator community (IC) is a community in a larger population where pathogens can be observed earlier due to its unique characteristics, similar to the canary in the coal mine analogy. This study investigated using a strategically selected IC as an early viral indicator for the City itself and five surrounding towns and cities. Wastewater surveillance was carried out at least three times per week for 2 years to track IAV, RSV, mpox, and SARS-CoV-2. The IC, a university campus, was selected based on its closed-loop sewer system, population demographics, and high social connectivity. Results showed that wastewater surveillance at a well-selected IC can serve as an early indicator of emerging and seasonal viruses, providing a necessary lead time of at least 1 week for timely public health interventions. While wastewater treatment plants typically offer 1–3 days of early detection, the IC approach extended this window to 1–3 weeks. The IC approach was particularly useful as an early indicator of new surges and outbreaks of seasonal respiratory viruses. The results also showed a consistent presence of SARS-CoV-2 wastewater viral signal in all communities, unlike the seasonal respiratory viruses, indicating an ongoing low-level transmission and circulation of SARS-CoV-2 throughout the year.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».