Complete Mitochondrial Genomes of Ancyromonads Provide Clues for the Gene Content and Genome Structures of Ancestral Mitochondria
Notice bibliographique
Résumé
Mitochondria of eukaryotic cells are direct descendants of an endosymbiotic bacterium related to Alphaproteobacteria. These organelles retain their own genomes, which are highly reduced and divergent when compared to those of their bacterial relatives. To better understand the trajectory of mitochondrial genome evolution from the last eukaryotic common ancestor (LECA) to extant species, mitochondrial genome sequences from phylogenetically diverse lineages of eukaryotes-particularly protists-are essential. For this reason, we focused on the mitochondrial genomes of Ancyromonadida, an independent and understudied protist lineage in the eukaryote tree of life. Here we report the mitochondrial genomes from three Ancyromonadida: Ancyromonas sigmoides, Nutomonas longa, and Fabomonas tropica. Our analyses reveal that these mitochondrial genomes are circularly mapping molecules with inverted repeats that carry genes. This inverted repeat structure has been observed in other mitochondrial genomes but is patchily distributed over the tree of eukaryotes. Ancyromonad mitochondrial genomes possess several protein-coding genes, which have not been detected from any other mitochondrial genomes of eukaryotes sequenced to date, thereby extending the known mitochondrial gene repertoire of ancestral eukaryotes, including LECA. These findings significantly expand our understanding of mitochondrial genome diversity across eukaryotes, shedding light on the early phases of mitochondrial genome evolution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».