DISTINCT CELL-BOUND COMPLEMENT ACTIVATION PRODUCTS ASSOCIATE WITH DISEASE ACTIVITY AND IMMUNE TRANSCRIPTIONAL SIGNATURES IN SLE
Notice bibliographique
Résumé
PV116 / #181 Poster Topic: AS14 - Innate Immunity Background/Purpose Complement plays a central role in SLE, generating an array of bioactive soluble and cell-bound complement activation products (CB-CAPs) during disease activity. Data are lacking though detailing the types, quantities, and impacts of the numerous CB-CAP on SLE immune cells, especially with respect to disease activity. We applied a mass cytometry (MC) panel that can detect over 20 CB-CAPs and complement receptors to PBMCs from paired flare and remission samples from 6 patients with classified SLE. Furthermore, we analyzed single-cell transcriptional profiles on flaring samples using antibodies to the most prevalent CB-CAPs using cellular indexing of transcriptomes and epitopes (CITE)-seq. Methods Adults with ACR- or SLICC-classified SLE were consented for PBMC collection at Washington University School of Medicine. Isolated PBMCs were subjected to single-cell MC (n = 6) and CITE-seq (n = 3). MC data analysis was performed with Cytobank. CITE-seq data analyses was performed with Seuret, gProfileR, and Comprehensive Multi-omics Platform for Biological InterpretatiOn (COMPBIO). Results We found the highest frequency of C4d, C3d, C5, and Bb deposition on B cells compared to T cells and monocytes during SLE flares (Figure 1). During disease remission, low levels of all CB-CAPs were observed in these cells. Compared to controls, transitional B cells from flaring patients with SLE had high levels of C5 and Bb with little C4d or C3d. CD11c + B cells from flaring patients also had elevated Bb deposition compared to controls. CITE-seq transcriptional profiling identified Bb- and C3d-bearing CD11c + B cells possessing a type I interferon signature, with Bb-bearing B cells further possessing a TNF/NF-κB transcriptional signature (Figure 2). Figure 1. Figure 2. Conclusions A high level of CB-CAP deposition was observed in B cells obtained from flaring subjects with a SLE, which was absent during disease remission. The types of CB-CAPs found on PBMCs were not uniform between cell types, potentially opening a previously undescribed heterogeneity in SLE. Additional heterogeneity was observed in the transcriptional profiles associated with specific CB-CAPs on B cells. These pilot data demonstrate the feasibility of the MC complement panel on human samples, and the potential insights CITE-seq has using CB-CAPs in discovering novel mechanisms of complement activation and regulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».