EXTRACELLULAR VESICLES FROM LUPUS NEPHRITIS PATIENTS INDUCE CHANGES IN THE TRANSCRIPTIONAL PROFILE OF MONOCYTES THAT RESEMBLE SLAN+ MONOCYTES
Notice bibliographique
Résumé
PV114 / #325 Poster Topic: AS12 - Genetics, Epigenetics, Transcriptomics Background/Purpose Extracellular Vesicles (EVs) are a source of autoantigens that can be recognized by circulating monocytes and can also form immune complexes. Lupus nephritis (LN) is the most frequent and severe manifestation in patients with systemic lupus erythematosus (SLE). Renal injury is attributed to the deposition of immune complexes in the glomerulus. SLAN+ monocytes, a fraction of non-classical monocytes considered the most inflammatory, have been detected in renal tissue. We analyzed the transcriptional profile and functional characteristics of monocytes and SLAN+/- monocyte fractions circulating in patients with LN and controls. Additionally, we studied the effect of EVs from the plasma of patients on the transcriptional profile of the SLAN- fraction. Methods We included 3 active LN female patients who meet the American College of Rheumatology/European Alliance of Associations for Rheumatology 2019 diagnosis criteria, with lupus nephritis confirmed by kidney biopsy following the International Society of Nephrology/Renal Pathology Society (ISN/RPS) parameters and in the initial phase of treatment and 3 healthy female donors (HD) of similar age in the study. Circulating monocytes SLAN+/- were purified from peripheral blood using FACS sorting. EVs were isolated from plasma using a differential centrifugation protocol. The SLAN- fraction was seeded with the isolated EVs for 6 hours. RNA from circulating monocyte SLAN+/- fractions and post-EV incubation samples was extracted using a commercial column kit. Transcriptomes were assessed by next-generation RNA sequencing on the Illumina Novaseq platform. Differential expression analysis was performed using the DESeq2 package. GeneCodis, GeneAnalytics, and GSEA platforms were employed for functional enrichment analysis of the most significant and differentially expressed genes (p-adj < 0.05 and FC > 1) between SLAN+/- fractions and to explore the effect of the EVs on the transcriptional profile of SLAN- monocytes. Results Gene expression profiling of monocytes from patients identified 51 genes that were differentially expressed between SLAN+ and SLAN-fractions. The SLAN+ monocytes from LN patients exhibited significant molecular changes, reflecting an inflammatory profile and pathways related to cell adhesion and differentiation. In contrast, the SLAN- fraction demonstrated a strong response to IFN-I. Additionally, EVs from LN patients prompted the SLAN- fraction from healthy donors to express 206 genes associated with an inflammatory profile and enriched SLAN+ signature, indicating differentiation potential. Conclusions These findings highlight the pathogenic potential of SLAN+ monocytes and EVs in lupus nephritis, suggesting they may serve as therapeutic targets. By altering the transcriptional profile of monocytes, EVs from LN patients could contribute to disease progression and inflammation. Targeting these pathways may offer new strategies for intervention in lupus nephritis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».