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Enregistrement W4410522265 · doi:10.1186/s13071-025-06807-x

Among-population proteomic differences in Schistocephalus solidus based on excretory/secretory and total body protein predictions

2025· article· en· W4410522265 sur OpenAlexaboutno aff
Anni Wang, Daniel I. Bolnick

Notice bibliographique

RevueParasites & Vectors · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity of Connecticut
Mots-clésSticklebackBiologyGasterosteusProteomeZoologyPopulationSolidusEvolutionary biologyEcologyBioinformaticsFisheryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Parasites secrete and excrete a variety of molecules that evolved to help establish and sustain infections within hosts. Parasite adaptation to their host may lead to between-population divergence in these excretory and secretory products (ESPs), but few studies have tested for intraspecific variation in helminth proteomes. METHODS: Schistocephalus solidus is a cestode that parasitizes the threespine stickleback, Gasterosteus aculeatus. We used an ultra-performance liquid chromatography-mass spectrometry protocol to characterize the ESPs and whole-body proteome of S. solidus. Specifically, we characterized the proteome of S. solidus at the plerocercoid stage from wild-caught stickleback from three lakes on Vancouver Island (British Columbia, Canada) and one lake in Alaska (USA). We tested for differences in proteome composition among the four populations and specifically between ESPs and body tissue. RESULTS: Overall, we identified 1362 proteins in the total proteome of S. solidus, with 542 of the 1362 proteins detected exclusively in the ESPs. Of the ESP proteins, we found signaling peptides and transmembrane proteins that had not been previously detected or characterized in S. solidus. We also found that protein spectrum counts varied greatly among all lake populations. CONCLUSIONS: These population-level differences were observed in both ESP and whole-body tissue types. Our study suggests that S. solidus can excrete and secrete a wide range of proteins which are distinct among populations. These differences might reflect plastic responses to host genotype differences, or evolved adaptations by Schistocephalus to different local host populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,720

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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