Transmembrane association of DDR1 and DDR2 mediated by Leucine zipper motifs
Notice bibliographique
Résumé
Discoidin domain receptors (DDRs) are single-pass transmembrane proteins belonging to receptor tyrosine kinases (RTKs) family, which are activated by collagen ligands with unusual slow, sustained kinetics, distinguishing them from canonical RTKs. While DDRs play critical roles in cell adhesion, differentiation, and cancer progression, their activation mechanisms remain partly understood. Here, we investigated the transmembrane domains (TMDs) of DDR1 and DDR2 to elucidate their interaction dynamics in membrane. Using bacterial adenylate cyclase two-hybrid (BACTH) assays, we demonstrated robust homotypic interactions and even stronger heterotypic associations between DDRTMDs. NMR spectroscopy of DDR1TMD and DDR2TMD reconstituted in lipid bilayer-mimetic bicelles showed obvious chemical shift alterations, further validating the stability of their heterocomplex formation. Systematic mutagenesis identified leucine zipper motifs rather than GXXXA motifs mediated both homo- and hetero-associations of DDR1TMD and DDR2TMD. These findings demonstrated the TMD as a critical mediator of DDRs oligomerization and revealed their interaction patterns within membrane. Our study advances the understanding of DDR signaling regulation and highlights transmembrane domain interactions as potential targets for modulating DDR-related pathologies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».