Transmitted/founder (T/F) HIV-1 derived from sexual contact exhibits greater transmission fitness in human cervical tissue than T/F HIV-1 from blood-to-blood contact: Unique glycan profiles on T/F envelopes associated with transmission phenotypes
Notice bibliographique
Résumé
Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) risk groups include, but are not limited to, heterosexual individuals (HET), men-who-have-sex-with-men (MSM), and people who inject drugs (PWID). Although genetically diverse HIV-1 populations are transferred from donor to recipient, systemic infection is often established by a single clone, the transmitted/founder (T/F) virus. This phenomenon is especially prevalent in sexual transmission, but less stringent in blood-to-blood contact transmission. Specific traits that permit successful transmission have not been well characterized. Thus, HIV-1 containing the chimeric T/F envelope (Env) from different transmission routes was assessed for ex vivo transmission fitness by performing mixed competition assays (also referred to as mixed competitions) on human cervical tissues. We found that chimeric T/F viruses isolated from the PWID exhibit limited replication capacity in cervical tissues when compared to those from MSM and HET, diminishing their chances of transmission to T helper type 1 (Th1) and Th17 cells. This reduced transmission fitness of T/F HIV-1 from PWID was not observed when infecting Th1 and Th17 cells directly, bypassing cervical tissues. Phenotypic assays showed that the chimeric T/F viruses from PWID differed from other groups by having an enhanced ability to utilize diverse CCR5 conformations, while Env expression level, CD4/CCR5 utilization, and entry speed did not differ. Different glycosylation profiles were detected on T/F compared to chronic Env with increased complex, fucosylated N- and O-glycans found more frequently on the T/F Env. Furthermore, the increased presence of these fucosylated glycans correlated with replication fitness in cervical tissues. In contrast, bisecting branched N-glycan found more frequently on chronic Env was associated with decreased entry efficiency and more stringent usage of CCR5. These findings suggest that glycosylation patterns/levels and/or Env structure greatly impact the differences in transmission fitness of T/F HIV-1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».