DISTINCT MOLECULAR PROFILES OF REMISSION POST-CD19 CAR-T CELL THERAPY VERSUS STANDARD IMMUNOSUPPRESSION IN SYSTEMIC LUPUS ERYTHEMATOSUS
Notice bibliographique
Résumé
O006 / #412 Topic:AS12 - Genetics, Epigenetics, Transcriptomics SCIENTIFIC HYBRID SESSION: CLINICAL TRACK PRESENTATIONS - OUTSTANDING ABSTRACT PRESENTATIONS 23-05-2025 9:00 AM - 10:00 AM Background/Purpose Remission, as defined by the Definition of Remission in SLE (DORIS) criteria, is the primary therapeutic target in systemic lupus erythematosus (SLE). While DORIS remission correlates with the reversal of key pathogenic processes,[1] novel approaches like CD19-targeted chimeric antigen receptor (CAR)-T cell therapy have shown potential to induce durable, drug-free remission. Yet, the molecular characteristics of CAR-T cell-induced remission compared to standard immunosuppression-induced remission remain unclear. Methods To delineate unique molecular profiles of CD19 CAR-T cell therapy-induced remission, we performed a comparative analysis of Reactome pathways. Pseudo-bulk expression profiles were generated from single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) in 7 SLE patients post-lymphodepletion and CAR-T cell infusion. As a comparator, transcriptional profiles from 34 SLE patients in DORIS remission on standard immunosuppression from the PRECISESADS project (1) were analyzed. Functional pathway annotations were derived using the Functional Analysis of Individual Microarray Expression (FAIME) algorithm. Results Of 314 pathways, 22 pathways related to the immune system were significantly differentially regulated, with CAR-T cell-induced remission being associated with a greater suppression of type I interferon, complement activation, and interleukin signaling pathways. Notably, Fc gamma receptor IIIa-mediated IL-10 synthesis and lipid metabolism pathways were selectively upregulated, suggesting enhanced antiinflammatory responses and metabolic rewiring. CD19 CAR-T cell-induced remission was also marked by decreased DNA damage response activation compared to remission on standard immunosuppression. Conclusions Our findings reveal a distinct immune and metabolic landscape associated with CD19 CAR-T cell-induced remission in SLE, supporting the notion of CD19 CAR-T cell-mediated immunological reset.References:[1] Parodis I. Ann Rheum Dis. 2024;83(7):889-900.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».