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Enregistrement W4410748172 · doi:10.1002/cbic.202500220

Chemical Switching: A Concept Inspired by Strategies from Biocatalysis and Organocatalysis

2025· review· en· W4410748172 sur OpenAlexfundno aff
Torkild Visnes, Kaixin Zhou, Aurino M. Kemas, Dominic J. Campopiano, Volker M. Lauschke, Maurice Michel

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInnovative Medicines InitiativeEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsOntario Institute for Cancer ResearchMcGill UniversityDiamond Light SourceKungliga Tekniska Högskolan
Mots-clésBiocatalysisOrganocatalysisFunction (biology)Protein functionSynthetic biologyDNABiochemical engineeringReactive intermediateChemistryNanotechnologyComputational biologyBiologyBiochemistryReaction mechanismEnantioselective synthesisMaterials scienceCatalysisGeneticsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this perspective the character of aldehyde functional groups is outlined as central intermediates in DNA repair. As highly reactive entities, aldehydes exist in limited quantities and in contextualized scenarios only and are commonly masked as a Schiff base. Recent advances reveal that principles of organic chemistry can modulate the enzymatic cleavage of Schiff bases, a process termed chemical switching. This approach not only enhances the production of canonical DNA repair products, bolstering cellular function, but also generates novel reaction intermediates, potentially rewiring cellular pathways. However, such rewiring could increase the complexity and toxicity of DNA repair intermediates, influencing therapeutic outcomes. To shape novel classes of therapeutics, an exploitation of these fine-tuned reaction principles requires expertise of enzymologists and scientists skilled in bio- and organocatalysis. Here, the current state of the art is outlined in chemically switching enzymatic function in cells with focus on DNA repair, highlighting challenges of this new type of protein modulation and discussing possible solutions. This paints a picture of the chemical switching concept as an emerging playing field with exciting translational prospects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,454
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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