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Enregistrement W4410774335 · doi:10.1016/j.ejmg.2025.105020

Variable expressivity of a transmitted pathogenic KAT6B variant

2025· article· en· W4410774335 sur OpenAlexaff
Pernille Axél Gregersen, Trine Østergaard Nielsen, Line Graven Lyngdorf, Casper Kruse, Michael Bayat, Philippe M. Campeau, Anne Skakkebæk

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Medical Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExpressivityGeneticsComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogenic variants in KAT6B (Lysine acetyltransferase 6B) are associated with two clinically overlapping autosomal dominant disorders Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson syndrome (SBBYSS) (OMIM 603736), and Genitopatellar syndrome (GPS) (OMIM 606170). More recently, the clinical spectrum of KAT6B disorders has expanded and KAT6B disorders have been suggested to consist of a spectrum of disorders with intermediate and overlapping clinical manifestations. Pathogenic variants in KAT6B mainly occur de novo, with only 3 reports of inherited variants. Here, we describe clinical and molecular findings in a three-generation Danish family with a segregating, previously unreported, pathogenic KAT6B variant. The variant is associated with a phenotype not otherwise specified (neither SBBYSS nor GPS) and with variable expressivity, adding further evidence that KAT6B disorders should be seen as a broad clinical spectrum. Furthermore, we highlight the existence of intra-familial variability and that pathogenic variants in KAT6B can be inherited from mildly affected parents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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