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Enregistrement W4410846663 · doi:10.1007/s13225-025-00556-z

Fungal diversity notes 1919–2016: taxonomic and phylogenetic contributions to fungal taxa

2025· article· en· W4410846663 sur OpenAlexaffabout
Bin Cao, Dorji Phurbu, Anna B. Ralaiveloarisoa, Kare Liimatainen, Tuula Niskanen, Virginia Ramírez-Cruz, Alexander J. Bradshaw, Bryn T. M. Dentinger, Florencia Ramírez-Guillén, Alonso Cortés-Pérez, Laura Guzmán‐Dávalos, Alma Rosa Villalobos-Arámbula, Oscar Castro-Jauregui, Paula Santos da Silva, Naveed Davoodian, Teresa Lebel, Michael A. Castellano, Tom W. May, Merje Toome, Jack Vasey, Katharina Höfer, M. Braithwaite, Lewis Braithwaite, Arun Kumar Dutta, Pinaki Chattopadhyay, Niranjan Roy, Bhaben Tanti, Pinky Rani Biswas, Elangovan Arumugam, Kezhocuyi Kezo, Malarvizhi Kaliyaperumal, Ramesh Murugadoss, Jing‐Xin Ji, Makoto Kakishima, Jerry Cooper, Jorinde Nuytinck, Zong-Long Luo, Wenpeng Wang, Xian Zhang, Ting‐Chi Wen, Xinlei Fan, Ning Jiang, Ning Jiao, Ying Zhang, Ishara S. Manawasinghe, Hua Li, Yin-Ru Xiong, Tao Zhou, Tamotsu Hoshino, Phaedra Lagaet, R. D. Lange, Annemieke Verbeken, Lowie Tondeleir, Cathrin Manz, Felix Hampe, Chang-Lin Zhao, Yang Yang, Guiqing Zhang, Dong-Qin Dai, Michal Tomšovský, Teodor T. Denchev, Cvetomir M. Denchev, Étienne Léveillé‐Bourret, Martin Kemler, Yanpeng Chen, Sajeewa S. N. Maharachchikumbura, Zixuan Feng, Long Wang, Qiming Wang, Shanping Wan, Fuqiang Yu, Jian‐Kui Liu, Hongzhi Du, Na Wu, Hongli Hu, Jian Su, Zonghua Wang, Yanping Hu, Hao Yu, Jing Wang, Yihua Yang, Wei Dong, Yongxin Shu, Haijun Zhao, Chao-Qun Wang, Chun-Fang Liao, Mingkwan Doilom, Guojie Li, Nakarin Suwannarach, Chanokned Senwanna, Yusufjon Gafforov, Adam Flakus, Tomasz Suchan, Óscar Plata, Pamela Rodriguez‐Flakus, Juna Tamang, Krishnendu Acharya, Hongde Yang, Ruvishika S. Jayawardena, Assiata Tiendrebeogo, Cony Decock, Irénée Somda, Anne Legrève, Yang Yu, Yuan-Pin Xiao, Jiaxin Li, Naritsada Thongklang, Xi-Xi Han, Wen-Qiang Yang, Shihui Wang, Mao-Qiang He, Kevin D. Hyde, Rui-Lin Zhao

Notice bibliographique

RevueFungal Diversity · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTaxonBiologyFungal DiversityMycologyPhylogenetic treePhylogenetic diversityBiodiversityEcologyPhylogeneticsTaxonomy (biology)ZoologyDiversity (politics)Evolutionary biologyBotanyAnthropologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This article is the 18th contribution to the Fungal Diversity Notes series, in which we document 98 taxa across two phyla, eight classes, 21 orders, 46 families, and 59 genera. The represent samples of taxa were collected from a diverse range of regions, including Australia, Benin, Bolivia, Burkina Faso, Cameroon, Canada, China, Czechia, India, Japan, Madagascar, Mexico, New Zealand, Sri Lanka, Thailand, Togo, USA, Uzbekistan and Venezuela. Among these, we introduce one new genus, 59 new species, 13 new combinations, one new name and 24 new records, along with information on their hosts and geographic distributions. The newly introduced genus is Fusicastoreum, and the newly described species include: Acrogenospora guangxiensis, Agaricus longistipitatus, A. sunanensis, Anthosulcatispora sichuanensis, Anthracoidea siccatae, Bjerkandera meridionalis, Camarophyllopsis brunnea, Candolleomyces analalavaensis, C. kely, C. macrosporus, Ceriporia yunnanensis, Choiromyces mongolicus, Colletotrichum duohuaense, Coprinus variicolor, Cystoderma alticola, C. microspore, C. yadongense, Cytospora lhaluensis, Diaporthe amberina, D. mangiferae, Elsinoe fuzhouensis, Epicocum maxima, Fulvifomes shailashikhara, Fusarium tuberculatum, Fusicastoreum arenarium, F. occidentale, F. pisiglareum, F. trappei, Gyalidea lluxitensis, Gymnopilus rimopileus, Hohenbuehelia triloba, Hymenagaricus ruber, Hypholoma darjeelingensis, Laccaria guizhouensis, Lactifluus aureoelephanti, L. croceivillus, Leucoagaricus ankarafantsikaensis, L. rutilus, Micropsalliota squamulosa, M. vinacea, Neomyrmecridium triseptatum, Niesslia wurfbainiae, Nigropunctata conspicosa, Ophiocordyceps jilinensis, Oxydothis dehongensis, Panaeolus ranwuensis, Pestalotiopsis buxicola, Pleurocordyceps puerensis, Pseudocercospora cunninghamia, Psilocybe zhushanensis, Remotididymella tachibana, Russula gaoligongensis, R. guilinensis, R. pseudovirescens, Sarocladium solani, Septoriella saviya-ramazanovaii, Seriascoma oblonga, Talaromyces pseudorugulosus and Tricholosporum madagascariense. Additionally, species newly transferred from Psilocybe include Deconica caespitosa, D. californica, D. goniospora, D. josecastilloi, D. latispora, D. novozoncuantlensis, D. oregonensis, D. venezuelana and D. vialis. Russula afroscrobiculata is newly transferred from Lactarius afroscrobiculatus, and Puccinia hamamelidis, P. hydrangeicola, P. philadelphi are newly transferred from Aecidium. Furthermore, the new name Puccinia shojiana is proposed as a replacement for Aecidium akebiae. The 24 new records of hosts and geographical distributions include: Agaricus pallidobrunneus, Bovista cretacea, Candolleomyces subsingeri, Clitopilus chichawatniensis, Collybiopsis gibbosa, C. subumbilicata, Curvularia geniculate, Cystoderma japonicum, Cytospora diatrypelloidea, C. schulzeri, Elsinoe leucospermi, Fulvifomes aurantiacus, Laccaria macrobasidia, Menisporopsis pandanicola, M. pirozynskii, Multifurca pseudofurcata, Musicillium elettariae, Myrmecridium pulvericola, Ophiocordyceps asiana, O. campes, Phellinus resupinatus, Phylloporia afrospathulata, Tropicoporus linteus and Typhula incarnate. All taxa are supported by both morphological and phylogenetic analyses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0120,013
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0000,003
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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