MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410851856 · doi:10.1371/journal.pcbi.1011859

Cellular morphodynamics as quantifiers for functional states of resident tissue macrophages in vivo

2025· article· en· W4410851856 sur OpenAlexaff
Miriam Schnitzerlein, Eric Greto, Anja Wegner, Anna Cäcilie Möller, Oliver Aust, Oumaima Ben Brahim, David B. Blumenthal, Vasily Zaburdaev, Stefan Uderhardt

Notice bibliographique

RevuePLoS Computational Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésIn vivoPopulationBeach morphodynamicsBiologyNeurosciencePhenotypeCellCell biologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Resident tissue macrophages (RTMs) are essential for tissue homeostasis. Their diverse functions, from monitoring interstitial fluids to clearing cellular debris, are accompanied by characteristic morphological changes that reflect their functional status. While current knowledge of macrophage behavior comes primarily from in vitro studies, their dynamic behavior in vivo is fundamentally different, necessitating a more physiologically relevant approach to their understanding. In this study, we employed intravital imaging to generate dynamic data from peritoneal RTMs in mice under various conditions and developed a comprehensive image processing pipeline to quantify RTM morphodynamics over time, defining human-interpretable cell size and shape features. These features allowed for the quantitative and qualitative differentiation of cell populations in various functional states, including pro- and anti-inflammatory activation and endosomal dysfunction. The study revealed that under steady-state conditions, RTMs exhibit a wide range of morphodynamical phenotypes, constituting a naïve morphospace of behavioral motifs. Upon challenge, morphodynamic patterns changed uniformly at the population level but predominantly within the constraints of this naïve morphospace. Notably, aged animals displayed a markedly shifted naïve morphospace, indicating drastically different behavioral patterns compared to their young counterparts. The developed method also proved valuable in optimizing explanted tissue setups, bringing RTM behavior closer to the physiological native state. Our versatile approach thus provides novel insights into the dynamic behavior of bona fide macrophages in vivo, enabling the distinction between physiological and pathological cell states and the assessment of functional tissue age on a population level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,653

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS Computational BiologyMême sujetImmune cells in cancerTravaux en français237 207