Structural Elucidation of a Unique Glycerophospho Lipid A From Phenol‐Phase Soluble Lipopolysaccharide of <i> <scp>Vibrio anguillarum</scp> Serovar SJ‐41 </i>
Notice bibliographique
Résumé
RATIONALE: In this study, the chemical structure of a unique lipid A derived from the phenol-phase soluble lipopolysaccharide (LPS) of Vibrio anguillarum serovar SJ-41, a virulent marine and freshwater pathogen, was investigated using electrospray ionization with field asymmetric wave ion mobility-Orbitrap mass spectrometry (ESI-FAIMS-MS). The analysis indicated that the obtained lipid A consisted of a heterogeneous mixture of molecules. High-energy collision dissociation tandem mass spectrometry (HCD-MS/MS) allowed the identification of unique chemical motifs of V. anguillarum lipid A. METHODS: ESI-FAIMS-MS, HCD-MS/MS, and Kendrick mass defect (KMD) plots were used to elucidate V. anguillarum lipid A molecular structure and mixture heterogeneity. RESULTS: Structural analysis revealed significant deviations from canonical lipid A, including the presence of a phospho-glycerol moiety located on primary acyl chain at the O-3 position of reducing sugar end and presence of novel di-hydroxylated primary acyl chains on the N-2' position of the non-reducing sugar end. As far as we know, this is the first report of lipid A structures containing both phospho-glycerol moiety and di-hydroxylated primary acyl chains. KMD plots were employed to investigate structural diversity of lipid A complex mixture. CONCLUSIONS: Tandem mass spectrometric analyses and KMD plots allowed the determination of lipid A structural diversity. These findings provide new insights into the lipid A composition of V. anguillarum strain SJ-41 and underscore the need for further studies to explore its biological implications, potentially reshaping our understanding of lipid A and its role in host-pathogen interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».