Antimicrobial-resistance of Escherichia coli in dogs and cats: A scoping review
Notice bibliographique
Résumé
Pathogenic Escherichia coli causes a range of clinical manifestations in dogs and cats, and the use of antimicrobials in pets is associated with the risk of antimicrobial resistance (AMR). Pets contribute to the dissemination of AMR both within their species and to humans. This study conducts a scoping review to assess the existing evidence on the AMR of E. coli in dogs and cats, noting the purpose of antimicrobial susceptibility testing (AST) and determining the knowledge gaps to inform future research. The search utilized specific and generic strings aligned with the research objectives, spanning databases such as MEDLINE®, Web of Science, Biological Science Collection, AGRICOLA, CAB Direct, and Google Scholar, from January 1990 to July 2023. The study selection included only articles published in English and related to primary research. Following deduplication, the initial search identified 1,205 studies. After a detailed full-text review, 108 independent studies were identified. Studies on the AMR of E. coli in companion animals are largely concentrated in North America and Western Europe. Most of the studies were observational and were conducted in veterinary clinics. AST was primarily conducted to guide the antimicrobial treatment of E. coli infections in pets. Although not all studies provided clinical histories, among those that did, multi-drug resistant (MDR) E. coli was reported in both healthy and ailing pets. The detection of MDR E. coli in healthy and sick pets serve as a clarion call for antimicrobial stewardship. However, the limited number of studies dedicated to AMR monitoring and surveillance programs for companion animals raises a substantial concern.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,026 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,019 | 0,016 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».