Effect of Marine Reference on Inferred Evolutionary Patterns of Freshwater Stickleback
Notice bibliographique
Résumé
Threespine stickleback are a model system for studying rapid and parallel evolution. Studies characterizing freshwater evolution often use contemporary marines as an ancestral proxy, an approach that relies on untested assumptions about the lack of phenotypic variance in these marine fish. Here, we survey marine individuals collected from several sites, asking whether there is evidence of phenotypic variation. We identified considerable phenotypic variation among fish from different sites. Thus, we investigated the impact of this phenotypic variance on the inferred pattern of freshwater evolution. We tested whether estimates of the magnitude of phenotypic divergence or parallelism were affected by the choice of marine reference. We found that for freshwater populations, the magnitude of phenotypic divergence was dependent on marine sampling location-with divergence estimates differing by up to 65% with the substitution of marine reference site. Geographic distance and environmental similarity between marine and freshwater sites explained some of the variance in these divergence estimates. In contrast, across marine sites, neither geographic distance nor environmental similarity predicted morphological similarity, suggesting other factors drive morphological divergence among marine fish. The magnitude of phenotypic parallelism, estimated using a multivariate vector-based approach, also differed significantly depending on the marine reference used. Together these results suggest that the choice of marine reference population, particularly its geographic distance from the focal population, is an important consideration when trying to characterize patterns of evolution in freshwater stickleback.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».