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Enregistrement W4410930213 · doi:10.1172/jci187490

PROX1 is an early driver of lineage plasticity in prostate cancer

2025· article· en· W4410930213 sur OpenAlexafffund
Zhi Duan, Mingchen Shi, Anbarasu Kumaraswamy, Dong Lin, Dhruv Khokhani, Yong Wang, Chao Zhang, Diana Flores, Eva S. Rodansky, Olivia A Swaim, William K. Storck, Hannah N Beck, Radhika A. Patel, Erolcan Sayar, Brian Hanratty, Xin Dong, Zoe R. Maylin, Rensheng Wan, David A. Quigley, Martin Sjöström, Ya‐Mei Hu, Faming Zhao, Zheng Xia, Siyuan Cheng, Xiuping Yu, Felix Y. Feng, Li Zhang, Rahul Aggarwal, Eric J. Small, Visweswaran Ravikumar, Arvind Rao, Karan Bedi, John K. Lee, Colm Morrissey, Ilsa Coleman, Peter S. Nelson, Eva Corey, Aaron M. Udager, Ryan J. Rebernick, Marcin Cieślik, Arul M. Chinnaiyan, Joel A. Yates, Michael C. Haffner, Yuzhuo Wang, Joshi J. Alumkal

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of General Medical SciencesInstitute for Prostate Cancer ResearchTerry Fox Research InstituteNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthBC Cancer FoundationProstate Cancer Foundation
Mots-clésProstate cancerLineage (genetic)ProstatePlasticityBiologyCancer researchCancerInternal medicineMedicineOncologyGeneticsGenePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lineage plasticity is recognized as a critical determinant of lethality and resistance to AR pathway inhibitors in prostate cancer. Lineage plasticity is a continuum, ranging from AR activity-low tumors, AR-null tumors that do not express a neuroendocrine prostate cancer (NEPC) program (i.e., double-negative prostate cancer [DNPC]), and AR-null NEPC tumors. Factors upregulated early in lineage plasticity are not well-characterized. The clarification of such factors is essential to identify tumors undergoing lineage plasticity or at risk of this occurring. Our integrative analysis of metastatic prostate cancer patient tumors, patient-derived xenografts, and cell models determined that PROX1 is upregulated early in the lineage plasticity continuum and progressively increases as tumors lose AR activity. We determined DNA methylation is a key regulator of PROX1 expression. PROX1 suppression in DNPC and NEPC reduces cell survival and impacts apoptosis and differentiation, demonstrating PROX1's functional importance. PROX1 is not directly targetable with standard drug development approaches. However, affinity immunopurification demonstrated histone deacetylases (HDACs) are among the top PROX1-interacting proteins; HDAC inhibition depletes PROX1 and recapitulates PROX1 suppression in DNPC and NEPC. Altogether, our results suggest PROX1 promotes the emergence of lineage plasticity, and HDAC inhibition is a promising approach to treat tumors across the lineage plasticity continuum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,465
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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