MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4410938554 · doi:10.1101/2025.05.30.657104

A Catalytically Inactive Protein Kinase C alpha Mutation Drives Chordoid Glioma by Pathway Rewiring

2025· preprint· en· W4410938554 sur OpenAlexfundno aff
Charlotte Bellamy, Hannah Tovell, Selina Schwaighofer, Timothy R. Baffi, Janan Arslan, Quentin Letourneur, Florent Dingli, Damarys Loew, Alexandr P. Kornev, Julie Lerond, Tiffany Kao, Stéphane Liva, Brigitte Izac, Muriel Andrieu, Homa Adle‐Biassette, Jean‐Vianney Barnier, Eduard Stefan, Marc Sanson, Alexandra C. Newton, Franck Bielle

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesTiroler WissenschaftsförderungSorbonne UniversitéDirection Générale de l’offre de SoinsNational Institutes of HealthInstitut National Du CancerUniversity of California, San DiegoLigue Contre le CancerPharmaceutical Research and Manufacturers of America FoundationAustrian Science FundGovernment of OntarioInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésInteractomeProtein kinase CImmunoprecipitationScaffold proteinMutantCell biologyMutationPhosphorylationBiologyKinaseSignal transductionChemistryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Summary Chordoid glioma (ChG) is a rare, low-grade brain tumor characterized by a novel recurrent point mutation, D463H, in the kinase domain of protein kinase C alpha (PKCα). The mutation is invariably an Asp to His substitution, suggesting it endows a unique function beyond catalytic inactivation associated with other cancer-associated PKCα mutations. Here we use in vitro and in cellulo activity assays to show that PKCα D463H is catalytically inactive, functions as a dominant-negative mutant to suppress endogenous PKC and uniquely rewires the cellular interactome. Specifically, phosphoproteomic, proximity labeling, and co-immunoprecipitation mass-spectrometry data from cells overexpressing PKCα D463H identify altered phosphorylation of substrates and binding to multiple proteins involved in cell-cell junctions compared to WT enzyme. Lastly, single nuclei RNAseq reveals that ChG derives from specialized tanycytes. Our data suggest that this disease-defining, fully penetrant mutation promotes neomorphic non-catalytic scaffolding to impair cell junction function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetinterferon and immune responsesTravaux en français237 207