The outer membrane transporter FadL was involved in the uptake of C18 <i>n</i>-alkane for enhancement of biodegradation in <i>Pseudomonas aeruginosa</i> TJM4
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: The removal of n-alkanes by bacteria is a promising strategy for bioremediation. Especially, the transmembrane transport of n-alkanes is a critical intermediate process for transfer and adsorption. Herein, the structure and function of two FadL outer membrane transporters in Pseudomonas aeruginosa TJM4 were explored to elucidate the impact on efficient removal of C18 n-alkanes. METHODS AND RESULTS: Phylogenetic analysis revealed considerable distinction in FadL sequences among strains involved in alkane catabolism. RT-qPCR analysis revealed that the expression of the two outer membrane transporter-encoding genes in strain TJM4, fadL1 and fadL2, was significantly upregulated in response to C18 n-alkane induction. To further investigate whether FadL was involved in the uptake and transport of C18 n-alkane, the fadL1 and fadL2 genes were deleted to generate mutants. Growth and degradation assays demonstrated that loss of the fadL gene reduced the ability of strain TJM4 to utilize and degrade C18 n-alkane, and FadL1 played a key role in the removal of C18 n-alkane. Moreover, the cell surface hydrophobicity (CSH) of the mutants was significantly lower than that of the wild-type (WT) strain TJM4. However, the complementation of fadL gene restored alkane degradation capacity and CSH of those mutant strains. These findings supported the role of FadL in enhancement of n-alkane catabolism. Finally, molecular docking analysis revealed hydrophobic interactions between the two FadL transporters and C18 n-alkane, in which Val, Leu, Ile, and Ala played a role in both complexes. CONCLUSIONS: Those results indicated that FadL was a pivotal step for removal of C18 n-alkane in strain TJM4. The pronounced differences in sequence between the two FadL transporters and their interaction sites with C18 n-alkane suggested that they might be substrate-specific involved in the n-alkane transport pathway of strain TJM4.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».