MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4411042727 · doi:10.1186/s12870-025-06773-7

Core construction establishment for Ruchengbaimao tea based on SSR markers

2025· article· en· W4411042727 sur OpenAlexaff
Yiming Liu, Yiting Zhang, Xinyi Zhang, Xiaoqin Yi, Feixiong Luo, Haitao Wen, Peidi Yang, Jianan Huang, Zhonghua Liu, Juan Li, Ligui Xiong

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFood Quality and Safety Studies
Établissements canadiensMinistry of Education and Child Care
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaChina Agricultural Research SystemNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyBiotechnologyComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germplasm collection and conservation requires many efforts and resources. Core collection construction could both conserve genetic diversity and improve conservation efficiency. This study investigated the genetic diversity of tea plants [ Camellia sinensis (L.) O. Kuntze] collected from four regions of Rucheng using 14 simple sequence repeat (SSR) markers and constructed a core collection set. A phylogenetic tree and population structure were conducted. A core set of 28 tea plants, approximately 10% of 279 tea plant individuals, was constructed to capture the samples' maximum genetic diversity. Compared to the original collection, the retention rates of N a , I , H o , H e , MAF, and PIC in the core collection were 106.4%, 118.8%, 103.1%, 112.2%, 68.1%, and 113.1%, respectively. The significance of core germplasm lies in identifying and conserving a set of representatives, diverse, and genetically advantageous genetic resources to support subsequent genetic improvement and breeding efforts. It could serve as a foundation for conserving valuable genetic materials and identifying loci associated with important horticultural traits, thereby empowering the development of new tea cultivars with enhanced efficiency. Furthermore, this approach contributes to optimizing breeding strategies, accelerating the selection process, and ensuring the sustainability of tea plant genetic resources for future generations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBMC Plant BiologyMême sujetFood Quality and Safety StudiesTravaux en français237 207