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Enregistrement W4411078979 · doi:10.1016/j.pmpp.2025.102783

Development of a rapid screen to identify formulations that enhance plant resistance to viral infection

2025· article· en· W4411078979 sur OpenAlexafffund
Fathy E. El-Gebaly, Wenzi Ckurshumova, Jun Liu, Michael Fefer, Evan C. Krysmanski, Robin K. Cameron

Notice bibliographique

RevuePhysiological and Molecular Plant Pathology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensSuncor Energy (Canada)Centennial CollegeMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsMcMaster University
Mots-clésBiologyResistance (ecology)Viral infectionVirologyBiotechnologyComputational biologyVirusEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A screening method was developed to identify formulations that enhance plant resistance to viral infection. A modified Tobacco rattle virus (TRV) genome with green fluorescent protein (TRV-GFP) was delivered into Nicotiana benthamiana cells using Agrobacterium tumefaciens . Subjective scales based on TRV-GFP fluorescence in inoculated and systemic leaves were created and validated by examining TRV coat protein expression using RT-PCR. This rapid 7-day Agrobacterium -TRV-GFP/ N. benthamiana screen was used to test many formulations containing sodium magnesium chlorophyllin (Mg-chl) with various surfactants. Treatment with Mg-chl formulation 1 and 2 resulted in significant reductions in TRV-GFP levels in N. benthamiana inoculated and systemic leaves compared to mock-treated plants, without causing phytotoxic effects. Given that Mg-chl is activated by light to produce reactive oxygen species (ROS), H 2 O 2 levels were examined and shown to increase in Mg-chl-treated leaves. Elevated H 2 O 2 levels may have initiated Salicylic acid (SA)- and Jasmonic acid (JA)-mediated resistance pathways as supported by expression of N.benthamiana Pathogenesis-Related1 ( NbPR1 ) and N.benthamiana Myelocytomatosis transcription factor ( NbMYC2) in formulation-treated leaves. Treatment with formulations 1 and 2 also provided resistance in Nicotiana tabacum leaves to Tobacco mosaic virus (TMV). Given that the JA pathway gene NbMYC2 was expressed in response to Mg-chl treatment, resistance to necrotrophic pathogens or insects may also be enhanced. Treatment with Mg-chl formulation 1 and 2 conferred resistance to TRV-GFP in N. benthamiana and TMV in N. tabacum without causing phytotoxic effects, indicating these formulations are ideal candidates for commercialization as plant immunity stimulators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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