Genetic Dissection Reveals New Components of the NHR-49 Multi-Stress Resistance and Longevity Pathway
Notice bibliographique
Résumé
Cells, tissues, and organisms encounter many environmental and endogenous stresses, and the ability to mount specific responses to these stresses is critical to achieve homeostasis and survival.Stress also occurs in many pathological states and is therefore of great biomedical relevance, both as a cause or contributor to diseases and as a potential therapeutic target.Pathways that regulate the responses to oxidative stress, hypoxia, and starvation are evolutionarily conserved from the nematode Caenorhabditis elegans to humans and involve master regulators of gene expression.One such stress response pathway engages C. elegans NHR-49, an orthologue of mammalian PPARα, which is required to survive tBOOH-induced oxidative stress, hypoxia, and starvation, and is also a key effector in many genetic longevity pathways.However, in contrast to other stress response pathways such as SKN-1/Nrf2 and HIF-1/HIF signaling, many aspects of NHR-49 signaling remain poorly understood.To map new components of this pathway, we performed reverse genetic screens, uncovering 80 candidate kinases, transcription factors, and transcriptional coregulators required for NHR-49-controlled gene activation in tBOOH, hypoxia, and/or starvation.Further analysis revealed that the kinase hpk-1/HIPK is required in the nhr-49 pathway for hypoxia and oxidative stress survival, that pseudokinase nipi-3 is required with nhr-49 for hypoxia survival, and that transcription factor nhr-80 is required with nhr-49 for hypoxia and oxidative stress survival and for the normal lifespan of wild-type C. elegans.Collectively, our data identify numerous new potential regulators in an important stress response and thus substantially enhance our understanding of stress adaptation and longevity regulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».