MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4411197975 · doi:10.1139/cjm-2024-0211

Isolation, identification, and community study of root fungal isolates from disturbed and undisturbed Arctic and alpine tundra habitats in Northern Quebec, Canada

2025· article· en· W4411197975 sur OpenAlexafffundvenueabout
Godar Sene, Marie-Ève Beaulieu, Stéphane Boudreau, Damase P. Khasa

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTundraArcticHabitatIsolation (microbiology)EcologyBiologyIdentification (biology)The arcticGeographyBotanyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In northern ecosystems such as the subarctic tundra, mining activities increase stress to a point where actions are needed to promote site reclamation. Ecological restoration of these mining-impacted sites with beneficial microorganisms, such as mycorrhizal fungi, is considered necessary and useful for the growth and survival of their host plants, but also for their tolerance to poor and contaminated environments, such as mine tailings. Here, we are interested in root symbionts associated with plants from the Schefferville mining site in northern Quebec. Very few studies of root fungal communities have been conducted in such a northern environment. The spatial and host plant variation of root fungal isolates was investigated. A total of 456 culturable fungi were isolated, of which 376 were successfully identified and assigned to 106 taxa based on rDNA internal transcribed spacer analysis using ITSF-1 and ITS-4 primers. The most commonly isolated fungi belonged to three genetically related groups: the Rhizoscyphus ericae aggregate, the dark septate endophytes, and Umbelopsis rammaniana and Mortierella sp., which are known to be genetically very close and often misclassified as one another. These groups were present on both disturbed and natural sites, but it appears that plants from disturbed sites had a greater affinity for dark septate endophytes. This study is the first step in the development of a restoration plan for the Schefferville mining site, and the baseline data obtained open new avenues for future studies, including the use of indigenous mycorrhizal-based biofertilizers to implement ecological revegetation strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,108

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission4
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of Microbiology→Même sujetPlant Pathogens and Fungal Diseases→Travaux en français237 207→