Epigenome‐wide association study of cerebrospinal fluid–based biomarkers of Alzheimer's disease in cognitively normal individuals
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers of Alzheimer's disease (AD) are reliable predictors of future AD risk. We investigated whether pre-clinical changes in AD CSF biomarkers are reflected in blood DNA methylation (DNAm) levels in cognitively normal participants. METHODS: We profiled blood-based DNAm with the EPIC array in participants without a diagnosis of cognitive impairment in the Emory Healthy Brain Study (EHBS; N = 495), Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (N = 122), and Parkinson's Progression Markers Initiative (N = 118) cohorts. Their CSF amyloid beta 42, total tau (t-tau), and phosphorylated tau181 levels were quantified using Elecsys immunoassays. We conducted epigenome-wide association studies to assess associations between DNAm and CSF biomarkers of AD. RESULTS: In EHBS, no loci were Bonferroni significant after adjusting for confounding factors. In the meta-analysis of all three cohorts, DNAm in cg22976567 (LMNA) was significantly associated with higher CSF t-tau levels. DISCUSSION: Our study showed little evidence of an association between differential blood-based DNAm and pre-clinical AD CSF biomarkers. HIGHLIGHTS: We conducted one of the largest (n = 735) blood DNA methylation (DNAm) studies of Alzheimer's disease cerebrospinal fluid (AD CSF) biomarkers. This is the first epigenome-wide association study in cognitively normal participants examining AD CSF biomarkers. Limited associations between blood DNAm and AD CSF biomarkers were identified.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».