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Enregistrement W4411238671 · doi:10.1093/toxsci/kfaf085

Leveraging toxicogenomics in a weight of evidence approach to demonstrate a CAR-mediated mode of action for cyclobutrifluram-related mouse liver tumors

2025· article· en· W4411238671 sur OpenAlexaff
Fang Zhang, Caleb C. Lord, Anikó Kende, David E. Cowie, Liam B. Doonan, Kathryn A. Bailey, Elizabeth F. McInnes, Angela Hofstra

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer, Stress, Anesthesia, and Immune Response
Établissements canadiensSyngenta (Canada)
Organismes subventionnairesSyngenta International
Mots-clésToxicogenomicsMode of actionAction (physics)Computational biologyBiologyCancer researchToxicologyBioinformaticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Toxicogenomics-based approaches are powerful tools for investigating the mode of action and human relevance of chemical-induced effects in animal toxicity studies, thus supporting human risk assessment and regulatory decisions. Here, we incorporated transcriptomics and metabolomics into a mode of action assessment of male mouse liver tumors observed following 80-week dietary exposure to cyclobutrifluram, a novel complex II succinate dehydrogenase inhibitor agrochemical. The assessment was conducted using the framework developed by the International Programme on Chemical Safety (IPCS) and the International Life Sciences Institute (ILSI), based on activation of the nuclear constitutive androstane receptor (CAR) and subsequent downstream events that have been established as human non-relevant. Cyclobutrifluram was shown to activate rat, mouse, and human CAR in in vitro transactivation assays. Dietary administration of cyclobutrifluram in male mice was associated with time- and/or dose-dependent liver weight increases, centrilobular hepatocellular hypertrophy, induction of CAR-related liver enzyme activity, specifically CYP2B and CYP3A, and hepatocellular proliferation. Transcriptomics analysis of mouse liver identified cyclobutrifluram-induced gene expression profiles consistent with CAR activation, based on published signatures and similarity to the reference CAR inducer phenobarbital. Metabolomics analysis of mouse plasma and liver further indicated that cyclobutrifluram induced similar biochemical changes as phenobarbital, with no evidence of any additional activity. Overall, this work demonstrates how toxicogenomics can provide valuable weight of evidence to identify the mode of action for chemical-induced rodent liver tumors and to exclude alternative modes of action.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,225
Score d'incertitude au seuil0,403

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,123
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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