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Enregistrement W4411255745 · doi:10.1111/nph.70286

Unstable anthocyanin pigmentation in <i>Streptocarpus</i> sect. <i>Saintpaulia</i> (African violet) is due to transcriptional selectivity of a single <scp>MYB</scp> gene

2025· article· en· W4411255745 sur OpenAlexfundno aff
Daichi Kurata, Tomohisa Tsuzaki, Fumi Tatsuzawa, Kenta Shirasawa, Hideki Hirakawa, Munetaka Hosokawa

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute for Basic BiologyInstitute of GeneticsKanazawa UniversityKindai University
Mots-clésMYBAnthocyaninBotanyBiologyGeneGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Saintpaulia (African violet) pigmentation is notoriously unstable and sometimes forms white stripes, particularly following passage through tissue culture. White-striped petals were thought to be due to periclinal chimeras, but we confirmed that white stripes result from epigenetic regulation rather than periclinal chimeras based on the flower color traits of plants obtained from tissue culture. Gene expression in several plant lines, anthocyanin quantification, bisulfite sequencing, and methylation analyses were used to demonstrate the presence of a single MYB gene responsible for pigment variation. We identified SiMYB2 as the cause of variations in tissue color patterning, and that two RNAs were generated from SiMYB2. SiMYB2-Long was expressed in colored tissues, while SiMYB2-Short was expressed only in noncolored tissues. Functional analyses revealed that SiMYB2-Long is an anthocyanin biosynthesis activator and SiMYB2-Short is nonfunctional. Exon 3 of SiMYB2 was generated by the insertion of a transposon-like sequence. A mutant lacking the element was obtained from cultivars with noncolored tissues. Anthocyanin content and SiMYB2-Long expression in the mutant were greatly increased compared to wild-type. Our results suggest that the white-striped petals of Saintpaulia are not formed by periclinal chimeras but through the transcriptional selectivity of epigenetically regulated SiMYB2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,985

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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